More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3953 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 314 aa  607  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  83.74 
 
 		 332 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  70.93 
 
 		 325 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  70.86 
 
 		 329 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  65.65 
 
 		 329 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  72.73 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  65.83 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  72.03 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  65.22 
 
 		 320 aa  371  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  68.38 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  67.12 
 
 		 318 aa  355  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  59.73 
 
 		 300 aa  354  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  68.94 
 
 		 333 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  70 
 
 		 313 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  59.94 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  59.94 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  66.33 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  64.24 
 
 		 322 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  64.24 
 
 		 322 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  61.19 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  62.96 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  59.52 
 
 		 319 aa  322  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  60.95 
 
 		 309 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  57.53 
 
 		 329 aa  318  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  60.81 
 
 		 366 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  55.18 
 
 		 373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  58.48 
 
 		 324 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  57.1 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  60.42 
 
 		 336 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  58.62 
 
 		 306 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  52.19 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  55.94 
 
 		 306 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  56.08 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  58.08 
 
 		 320 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  55.74 
 
 		 302 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  53.71 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  51.55 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  49.17 
 
 		 309 aa  248  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  44.9 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  45.24 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  43.21 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  38.66 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  40.56 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  38.57 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  42.66 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  37.33 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  36.99 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 		 321 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  36.99 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  40.69 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  37 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  36.99 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  36 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  36.64 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  36.64 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.64 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.3 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  37.67 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  39.85 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  36.98 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  36.3 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.71 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.16 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  38.19 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  36.95 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  38.54 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  41.28 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  38.54 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  38.54 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  38.54 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  35.86 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  38.21 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  36.9 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  34 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  42.56 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  34.33 
 
 		 347 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  37.62 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  38.15 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  37.22 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  37.06 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  38.94 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  37.16 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  41.67 
 
 		 365 aa  165  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1837  cation diffusion facilitator family transporter  35.87 
 
 		 334 aa  165  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  36.2 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  38.49 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  37.55 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  37.08 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  37.08 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  40.07 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>