More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3694 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3694  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 290 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.816897  hitchhiker  0.00301236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2821  polyprenyl synthetase  80.99 
 
 		 289 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230179  normal  0.537007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2954  Polyprenyl synthetase  80.28 
 
 		 288 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0123408  normal  0.0660795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2727  polyprenyl synthetase  80.63 
 
 		 288 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0712991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2849  Polyprenyl synthetase  81.47 
 
 		 288 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2983  farnesyl-diphosphate synthase  67.13 
 
 		 289 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6440  farnesyl-diphosphate synthase  60.07 
 
 		 289 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1909  polyprenyl synthetase  57.14 
 
 		 292 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0962884  normal  0.361661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0265  farnesyl-diphosphate synthase  56.79 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2039  polyprenyl synthetase  55.71 
 
 		 288 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.678987  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2049  Polyprenyl synthetase  64.34 
 
 		 289 aa  288  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1290  polyprenyl synthetase  59.23 
 
 		 288 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1707  Polyprenyl synthetase  55.4 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1613  polyprenyl synthetase  59.86 
 
 		 291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4004  polyprenyl synthetase  57.49 
 
 		 287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  hitchhiker  0.00057094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3759  polyprenyl synthetase  57.84 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3514  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  54.8 
 
 		 292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0182  farnesyl-diphosphate synthase  53.33 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  43.55 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  43.15 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  37.73 
 
 		 300 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  37.26 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  37.26 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  37.26 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  37.9 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  38.98 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  42.17 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  36.47 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  40.07 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  35.77 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  35.77 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  36.82 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  36.23 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  37.31 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  40.64 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  39.61 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  43.14 
 
 		 314 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  37.64 
 
 		 312 aa  146  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  41.2 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  42.91 
 
 		 327 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  36.88 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  37.89 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  36.74 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  43.68 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  38.65 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  40.91 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  38.19 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  39.84 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  38.15 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  44.18 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  42.02 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  35.88 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  37 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  38.19 
 
 		 293 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  39.69 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  38.19 
 
 		 293 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  38.19 
 
 		 293 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  43.89 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  37.89 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  38.72 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  39.45 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  40.16 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  39.93 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  38.43 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  41.8 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  42.75 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  37.82 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  43.21 
 
 		 294 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0955  Polyprenyl synthetase  42.57 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  41.46 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  43.4 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  43.4 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  40.76 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  43.4 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  43.4 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  43.4 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  43.21 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  36.29 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  38.37 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  43.4 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  43.4 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  38.37 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  39.08 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  42.8 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  42.8 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  43.35 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2876  polyprenyl synthetase  42.02 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  35.88 
 
 		 299 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  42.29 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  38.55 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  42.8 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  42.8 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  42.8 
 
 		 294 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  39.38 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  40.33 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  42.4 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  36.71 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  36.05 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>