More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2837 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  100 
 
 
121 aa  240  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  73.55 
 
 
121 aa  175  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  69.42 
 
 
121 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  74.76 
 
 
122 aa  155  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  74.51 
 
 
122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  71.59 
 
 
324 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  72.73 
 
 
358 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  67.03 
 
 
360 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  67.03 
 
 
360 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  59.32 
 
 
115 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  70.97 
 
 
200 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  69.23 
 
 
335 aa  128  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  59.32 
 
 
115 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  67.01 
 
 
199 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  66.67 
 
 
211 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  69.89 
 
 
200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  62.37 
 
 
238 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  60.38 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  65.91 
 
 
342 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  65.56 
 
 
230 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  65.56 
 
 
242 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  65.56 
 
 
242 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  65.56 
 
 
230 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  64.52 
 
 
211 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  64.52 
 
 
211 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  64.52 
 
 
211 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  68.48 
 
 
124 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
170 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  64.77 
 
 
163 aa  122  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  67.74 
 
 
212 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
199 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  63.74 
 
 
367 aa  121  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  56.2 
 
 
124 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  54.92 
 
 
124 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  67.78 
 
 
115 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  62.37 
 
 
198 aa  121  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  62.5 
 
 
279 aa  120  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  64.52 
 
 
203 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  68.48 
 
 
124 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  64.52 
 
 
203 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  55.37 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  59.57 
 
 
230 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  62.37 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  64.84 
 
 
282 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
243 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  62.77 
 
 
367 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  66.27 
 
 
303 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  67.74 
 
 
371 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  50 
 
 
150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  62.37 
 
 
322 aa  117  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
259 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  59.14 
 
 
254 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
124 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
206 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  62.37 
 
 
214 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  65.12 
 
 
157 aa  115  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  66.27 
 
 
213 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  62.22 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
206 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  55.2 
 
 
134 aa  115  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  56.3 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  61.05 
 
 
196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  61.29 
 
 
249 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  56.76 
 
 
251 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
258 aa  115  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  63.64 
 
 
165 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  65.17 
 
 
140 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  56.52 
 
 
239 aa  115  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  61.29 
 
 
227 aa  114  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  54.47 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  65.17 
 
 
116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  60.22 
 
 
213 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  60.22 
 
 
203 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  62.5 
 
 
94 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  60 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
262 aa  113  8.999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  60.22 
 
 
213 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  60.23 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  55.45 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  68.09 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
246 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  55.43 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  50 
 
 
145 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  64.13 
 
 
171 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  60 
 
 
253 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  48.31 
 
 
166 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  58.24 
 
 
263 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  67.03 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
275 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
275 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
221 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  56.99 
 
 
297 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
249 aa  110  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
266 aa  110  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
171 aa  110  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  59.09 
 
 
342 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  51.3 
 
 
181 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>