More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2744 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  100 
 
 		 342 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  92.4 
 
 		 342 aa  624  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  88.3 
 
 		 340 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  84.21 
 
 		 339 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  84.21 
 
 		 339 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  83.04 
 
 		 339 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  80 
 
 		 340 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  79.57 
 
 		 335 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  78.83 
 
 		 337 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  76.99 
 
 		 332 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  77.85 
 
 		 334 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  74.31 
 
 		 348 aa  502  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  73.93 
 
 		 332 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  73.62 
 
 		 332 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  71.73 
 
 		 332 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  73.31 
 
 		 332 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  71.47 
 
 		 332 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  71.47 
 
 		 332 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  71.78 
 
 		 332 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  71.78 
 
 		 332 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  71.17 
 
 		 332 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5878  transketolase central region  70.69 
 
 		 333 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  68.5 
 
 		 338 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  65.77 
 
 		 333 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0727  transketolase central region  70.55 
 
 		 335 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  70.03 
 
 		 347 aa  448  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  66.56 
 
 		 340 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  63.06 
 
 		 331 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  63.8 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0406  Transketolase central region  67.18 
 
 		 343 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  70.93 
 
 		 288 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3347  Transketolase central region  63.24 
 
 		 331 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.027962  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2506  Transketolase central region  62.15 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.165482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  45.54 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  43.51 
 
 		 306 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0901  transketolase, central region  43.47 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  41.12 
 
 		 333 aa  232  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  44.11 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  42.39 
 
 		 314 aa  229  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  42.39 
 
 		 314 aa  229  7e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  40.86 
 
 		 305 aa  229  7e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  42.72 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  46.15 
 
 		 311 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  42.76 
 
 		 312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  41.69 
 
 		 326 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  41.53 
 
 		 310 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  39.74 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  40.95 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  41.37 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  37.87 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  40.86 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  40.45 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  40.85 
 
 		 317 aa  219  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  43.37 
 
 		 313 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  40.81 
 
 		 327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  43.81 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  46.41 
 
 		 311 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  41.42 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  37.34 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  39.53 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  43.04 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  38.54 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  41.78 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  40.45 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  45 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  41.2 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  37.21 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  37.54 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  36.21 
 
 		 312 aa  205  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  37.25 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  37.38 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  35.88 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  39.55 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  38.83 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  36.86 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  37.5 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  34.89 
 
 		 635 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  43.89 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  43.69 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  35.46 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  38.19 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  43.42 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  39.87 
 
 		 314 aa  189  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  37.67 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  38.34 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  37.62 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  34.78 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  35.16 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  37.19 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  36.66 
 
 		 317 aa  182  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  42.58 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  38.21 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  38.7 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  38.68 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  41.37 
 
 		 308 aa  180  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  42.25 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  40.46 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  42.13 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0671  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  33.92 
 
 		 643 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2182  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  36.31 
 
 		 625 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0455646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>