More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2462 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2462  ROK family protein  100 
 
 		 315 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2841  ROK family protein  100 
 
 		 315 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20695  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1371  glucokinase  42.76 
 
 		 306 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  37.79 
 
 		 303 aa  146  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  34.88 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  34.03 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  36.59 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  34.15 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.53 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  36.11 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  32.57 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  33.64 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  34.77 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  36.93 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  31.72 
 
 		 302 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.14 
 
 		 320 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  29.14 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.5 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  27.44 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  34.78 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  30.29 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  30.79 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.22 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  30.79 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  26.71 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  33.94 
 
 		 313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  34.4 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.48 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.48 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  30.86 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  27.67 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1913  ROK family protein  35.43 
 
 		 326 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.435171  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  31.11 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0649  ROK family protein  32.4 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  30.65 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  32.44 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  31.76 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  30.82 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.19 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3960  ROK family protein  30.55 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  33.23 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  30.74 
 
 		 321 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  32.82 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  36.2 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.5 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.48 
 
 		 503 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  26.36 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  32.84 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.04 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  28.34 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.34 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  33.23 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.34 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  29.64 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.34 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.34 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.53 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.51 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0014  ROK family protein  30.62 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  28.34 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  30.92 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  34.36 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  31 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  26.99 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.96 
 
 		 408 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.38 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  32.2 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  31.11 
 
 		 392 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  32.9 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1875  glucokinase  25.89 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173781  hitchhiker  0.00131381 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  27.27 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  32.44 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  32.42 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  30.14 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  28.85 
 
 		 333 aa  99.4  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  28.92 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  30.65 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  29.15 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  29.1 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  25.08 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.56 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.23 
 
 		 406 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  30.59 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  31.71 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  28.44 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  32.64 
 
 		 384 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  32.87 
 
 		 381 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  36.41 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.46 
 
 		 417 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  32.51 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  37.67 
 
 		 361 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  30.31 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  29.14 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  25.55 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  29.84 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.11 
 
 		 434 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0528  ROK family protein  30.42 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0813  ROK family protein  29.55 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  26.71 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  31.07 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>