More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1533 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 750 aa  1488    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  47.56 
 
 		 700 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  45.88 
 
 		 741 aa  600  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  46.51 
 
 		 705 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  47.43 
 
 		 732 aa  597  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  46.3 
 
 		 720 aa  595  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  43.99 
 
 		 733 aa  585  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 		 733 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 		 739 aa  569  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 		 756 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 709 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 702 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 686 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 709 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 682 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  40.03 
 
 		 724 aa  439  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  38.32 
 
 		 708 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  36.65 
 
 		 686 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  38.31 
 
 		 681 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 712 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  37.01 
 
 		 707 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  38.44 
 
 		 701 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 708 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 698 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 697 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 688 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 654 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 652 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  36.84 
 
 		 720 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 691 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.84 
 
 		 693 aa  416  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 696 aa  415  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  31.31 
 
 		 714 aa  413  1e-114  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 702 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 694 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 699 aa  402  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 679 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 686 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  33.98 
 
 		 685 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  36.11 
 
 		 669 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  35.97 
 
 		 703 aa  389  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 702 aa  385  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  35.92 
 
 		 681 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  36.6 
 
 		 662 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 682 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 695 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 688 aa  372  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 751 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 751 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.02 
 
 		 806 aa  365  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 707 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  36.03 
 
 		 717 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  36.36 
 
 		 715 aa  357  5.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 677 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 724 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 684 aa  353  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  35.7 
 
 		 717 aa  353  7e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  36.01 
 
 		 727 aa  352  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 694 aa  348  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  34.76 
 
 		 704 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  33.2 
 
 		 702 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  36.51 
 
 		 758 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 770 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 684 aa  337  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 		 536 aa  331  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 654 aa  330  7e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  44.16 
 
 		 654 aa  330  8e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  44.16 
 
 		 654 aa  330  8e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  44.16 
 
 		 654 aa  330  8e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  44.5 
 
 		 674 aa  330  9e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  43.94 
 
 		 654 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  44.16 
 
 		 654 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  43.96 
 
 		 652 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  44.16 
 
 		 652 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  44.16 
 
 		 654 aa  328  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  44.75 
 
 		 655 aa  326  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  30.76 
 
 		 670 aa  324  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  45.84 
 
 		 672 aa  324  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  46.15 
 
 		 669 aa  324  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  33.61 
 
 		 711 aa  324  4e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  46.15 
 
 		 669 aa  324  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  46.15 
 
 		 669 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  46.15 
 
 		 669 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  46.15 
 
 		 669 aa  323  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  44.42 
 
 		 784 aa  323  9.000000000000001e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 684 aa  320  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  29.74 
 
 		 670 aa  319  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  29.83 
 
 		 667 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  45.19 
 
 		 673 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  30.06 
 
 		 801 aa  318  3e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  29.74 
 
 		 667 aa  318  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  29.74 
 
 		 667 aa  318  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 697 aa  317  6e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  45.12 
 
 		 726 aa  316  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 		 725 aa  316  9e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 724 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 724 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 749 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 679 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  47.06 
 
 		 744 aa  313  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>