More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1177 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1177  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 286 aa  569  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1821  pantoate--beta-alanine ligase  67.47 
 
 		 283 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0333652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4094  pantoate--beta-alanine ligase  65.96 
 
 		 283 aa  362  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0933  pantoate--beta-alanine ligase  65.64 
 
 		 283 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1155  pantothenate synthetase  65.52 
 
 		 281 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3853  pantoate--beta-alanine ligase  66.21 
 
 		 282 aa  345  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3034  pantoate--beta-alanine ligase  62.85 
 
 		 282 aa  345  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0895  pantoate--beta-alanine ligase  63.45 
 
 		 282 aa  341  9e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136564  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2387  pantoate--beta-alanine ligase  57.44 
 
 		 283 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513339 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  58.04 
 
 		 274 aa  325  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  57.79 
 
 		 282 aa  325  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2600  pantoate--beta-alanine ligase  56.75 
 
 		 283 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.174782  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0029  pantoate--beta-alanine ligase  62.5 
 
 		 280 aa  322  6e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2196  pantoate--beta-alanine ligase  56.75 
 
 		 283 aa  321  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2774  pantoate--beta-alanine ligase  56.64 
 
 		 280 aa  318  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.8833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0848  pantoate--beta-alanine ligase  56.14 
 
 		 279 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2447  pantoate--beta-alanine ligase  55.79 
 
 		 279 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124687  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  55.79 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  55.79 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  55.79 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  55.79 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  55.79 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  55.79 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  55.79 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2197  pantoate--beta-alanine ligase  55.79 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347128  normal  0.875229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1831  pantoate--beta-alanine ligase  55.44 
 
 		 279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2442  pantoate--beta-alanine ligase  55.44 
 
 		 279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0852  pantoate--beta-alanine ligase  56.14 
 
 		 279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  54.33 
 
 		 283 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2357  pantoate--beta-alanine ligase  55.09 
 
 		 279 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  0.238844 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5773  pantoate--beta-alanine ligase  54.74 
 
 		 279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417001  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  53.63 
 
 		 283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1010  pantoate--beta-alanine ligase  56.84 
 
 		 277 aa  309  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2823  pantoate--beta-alanine ligase  62.93 
 
 		 290 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3488  pantoate--beta-alanine ligase  56.84 
 
 		 277 aa  308  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3500  pantoate--beta-alanine ligase  63.14 
 
 		 289 aa  308  8e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2489  pantoate--beta-alanine ligase  54.74 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2767  pantoate--beta-alanine ligase  60.38 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1934  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0878  pantoate--beta-alanine ligase  53.33 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  57.89 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  51.58 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  51.05 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 287 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 287 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  51.58 
 
 		 287 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  52.63 
 
 		 283 aa  245  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50.17 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  50.17 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.77 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  48.6 
 
 		 281 aa  236  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  46.34 
 
 		 283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  45.99 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  47.93 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  44.25 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  52.09 
 
 		 284 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  46.15 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  43.55 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 		 286 aa  229  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  53.33 
 
 		 334 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 281 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 		 284 aa  228  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 281 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  46.5 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  43.51 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  48.08 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  43.9 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 284 aa  225  8e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  48.78 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  41.9 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  48.28 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 288 aa  221  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 281 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  48.1 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  45.1 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  48.78 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  45.1 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  44.21 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>