More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1396 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1396  preprotein translocase subunit YidC  100 
 
 		 327 aa  665    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000130434  hitchhiker  1.60248e-23 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1223  60 kDa inner membrane insertion protein  38.23 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.092902  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0292  OxaA-like protein precursor  34.69 
 
 		 305 aa  195  9e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000376025  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1729  preprotein translocase subunit YidC  34.59 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0758405  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0588  OxaA-like protein precursor  35.28 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000375081  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1608  OxaA-like protein precursor  35.76 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000470187  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0914  preprotein translocase subunit YidC  32.46 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085112  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1697  hypothetical protein  30.57 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2127  60 kDa inner membrane insertion protein  30.3 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000805212  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2165  60 kDa inner membrane insertion protein  30.3 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.001129  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2021  hypothetical protein  26.91 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0148683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  33.49 
 
 		 583 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.02 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  29.28 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  31.5 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  30.45 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  29.72 
 
 		 255 aa  99.4  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  29.72 
 
 		 255 aa  99.4  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  29.72 
 
 		 255 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  29.72 
 
 		 255 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  29.72 
 
 		 255 aa  99.4  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  30.52 
 
 		 255 aa  99.4  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  29.7 
 
 		 255 aa  99  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  29.85 
 
 		 258 aa  99  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  29.32 
 
 		 255 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  28.92 
 
 		 260 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  30.51 
 
 		 260 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  29.66 
 
 		 260 aa  95.9  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  29.66 
 
 		 260 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  29.66 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  30.19 
 
 		 260 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  29.72 
 
 		 255 aa  93.6  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  29.24 
 
 		 260 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  29.24 
 
 		 260 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  29.24 
 
 		 260 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  29.24 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  29.69 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.21 
 
 		 526 aa  90.1  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 		 532 aa  89.7  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.51 
 
 		 517 aa  86.3  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  32.43 
 
 		 291 aa  86.3  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  29.13 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  28.57 
 
 		 330 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  28.18 
 
 		 313 aa  85.9  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  29.52 
 
 		 278 aa  85.9  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  35.03 
 
 		 209 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  26.27 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  32.28 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 553 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 552 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 552 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 553 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.83 
 
 		 555 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.98 
 
 		 554 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.98 
 
 		 554 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 554 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.44 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 557 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.83 
 
 		 541 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.83 
 
 		 554 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.41 
 
 		 530 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.41 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.9 
 
 		 555 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.43 
 
 		 518 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.38 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  27.73 
 
 		 553 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.29 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.74 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  27.06 
 
 		 559 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.41 
 
 		 530 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  28.18 
 
 		 569 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.03 
 
 		 550 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  28.38 
 
 		 540 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  27.27 
 
 		 570 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  26.29 
 
 		 570 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  32.14 
 
 		 223 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.44 
 
 		 555 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  28.7 
 
 		 539 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.95 
 
 		 581 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 		 545 aa  77.4  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 		 541 aa  77.8  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  29.55 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  29.55 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  26.82 
 
 		 570 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  26.29 
 
 		 557 aa  77  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.55 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.58 
 
 		 552 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>