More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0505 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0505  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  100 
 
 
597 aa  1238    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.34 
 
 
603 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1624  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.3 
 
 
524 aa  239  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.74 
 
 
491 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2695  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.37 
 
 
549 aa  157  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0528  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.94 
 
 
550 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.603019  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2757  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.43 
 
 
530 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  27.79 
 
 
514 aa  146  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0532  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.71 
 
 
553 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.642079  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2690  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25 
 
 
557 aa  134  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0579  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.35 
 
 
533 aa  133  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000350178  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.8 
 
 
485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.339209 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  30.78 
 
 
599 aa  126  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2538  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.09 
 
 
596 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0777  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29 
 
 
566 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2702  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.03 
 
 
489 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5790  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 
523 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545575  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  30.22 
 
 
597 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  27.32 
 
 
542 aa  112  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  24.05 
 
 
508 aa  110  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  25.46 
 
 
584 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  27.65 
 
 
505 aa  107  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  26.92 
 
 
609 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.91 
 
 
550 aa  98.6  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  27.88 
 
 
925 aa  97.8  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  25.57 
 
 
1005 aa  97.4  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  26.63 
 
 
637 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.34 
 
 
523 aa  95.9  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  26.59 
 
 
631 aa  94.7  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  26.65 
 
 
650 aa  93.2  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0779  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.56 
 
 
566 aa  93.2  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  25.62 
 
 
598 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  26.03 
 
 
582 aa  92  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  25.49 
 
 
582 aa  91.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  26.05 
 
 
589 aa  91.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.25 
 
 
509 aa  90.9  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  27.58 
 
 
925 aa  90.1  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.65 
 
 
509 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  25.87 
 
 
588 aa  89.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  24.81 
 
 
582 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  24.81 
 
 
582 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  27.38 
 
 
589 aa  88.6  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  25 
 
 
957 aa  88.6  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  26.17 
 
 
1004 aa  88.6  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  27.41 
 
 
596 aa  88.2  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.3 
 
 
523 aa  87.4  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.68 
 
 
488 aa  87  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  28.27 
 
 
596 aa  87  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  25.67 
 
 
506 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  23.97 
 
 
521 aa  85.1  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  28.53 
 
 
583 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  26.25 
 
 
464 aa  84  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.8 
 
 
465 aa  82.4  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  26.99 
 
 
586 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.95 
 
 
616 aa  82  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.2 
 
 
578 aa  81.6  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  26.92 
 
 
520 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  25.99 
 
 
593 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  24.01 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  25.61 
 
 
512 aa  80.5  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  24.53 
 
 
582 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26990  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.5 
 
 
551 aa  80.1  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  27.61 
 
 
596 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0293  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.94 
 
 
568 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  25.9 
 
 
596 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0303  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.94 
 
 
568 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.1 
 
 
576 aa  79.7  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  26.28 
 
 
586 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  24.84 
 
 
598 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  23.24 
 
 
560 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.39 
 
 
482 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.66 
 
 
515 aa  79.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3358  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.7 
 
 
564 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12630  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.1 
 
 
545 aa  78.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1395  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.85 
 
 
619 aa  78.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  26.1 
 
 
591 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0284  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.65 
 
 
568 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  23.09 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.78 
 
 
502 aa  77.8  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2865  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.53 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417281  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  24.8 
 
 
596 aa  77  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  24.64 
 
 
506 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  23.63 
 
 
511 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  21.5 
 
 
493 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.9 
 
 
519 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  24.54 
 
 
524 aa  75.5  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  24.27 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  22.98 
 
 
926 aa  74.7  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.7 
 
 
577 aa  75.1  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  24.44 
 
 
519 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  24.95 
 
 
511 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  25.97 
 
 
605 aa  74.3  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4567  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.3 
 
 
566 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420272  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.85 
 
 
517 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.82 
 
 
569 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  23.8 
 
 
598 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0232  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.51 
 
 
523 aa  73.9  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0397857  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  24.51 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  28.06 
 
 
591 aa  73.9  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.05 
 
 
529 aa  73.6  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>