More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1395 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_24390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  78.13 
 
 
573 aa  907    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1395  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
619 aa  1276    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03140  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  34.86 
 
 
594 aa  296  8e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2119  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.43 
 
 
616 aa  260  5.0000000000000005e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0348358  normal  0.647949 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0968  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.91 
 
 
610 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168155  hitchhiker  0.00000916936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  26.22 
 
 
511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.86 
 
 
555 aa  127  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0172  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25 
 
 
560 aa  124  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.79854  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.39 
 
 
572 aa  120  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.221964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3387  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.39 
 
 
557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2787  twin-arginine translocation pathway signal  24.53 
 
 
553 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.41 
 
 
519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  25.86 
 
 
464 aa  114  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2291  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.3 
 
 
565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.7 
 
 
534 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.14 
 
 
523 aa  109  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  26 
 
 
512 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.61 
 
 
482 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1103  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.6 
 
 
598 aa  107  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.4 
 
 
509 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0986  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.08 
 
 
567 aa  106  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3694  twin-arginine translocation pathway signal  24.91 
 
 
559 aa  106  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.57 
 
 
509 aa  104  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12470  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.24 
 
 
566 aa  103  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.967758  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.52 
 
 
561 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0288  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.6 
 
 
557 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26990  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.54 
 
 
551 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.4 
 
 
523 aa  101  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.64 
 
 
556 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.7 
 
 
555 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.449651  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  23.64 
 
 
597 aa  98.2  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  23.53 
 
 
507 aa  98.2  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.14 
 
 
578 aa  95.1  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3618  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.59 
 
 
560 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3684  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.59 
 
 
592 aa  94  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.504489  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  23.69 
 
 
521 aa  94  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0524  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.88 
 
 
584 aa  92.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.106039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  24.71 
 
 
657 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0801  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.79 
 
 
598 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13560  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.26 
 
 
549 aa  91.7  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0363  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.34 
 
 
567 aa  91.7  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.629419 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  23.4 
 
 
1005 aa  91.3  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  24.31 
 
 
519 aa  91.3  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0596  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.15 
 
 
588 aa  91.3  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.721596 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.9 
 
 
457 aa  91.3  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  26.48 
 
 
487 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  23.06 
 
 
589 aa  90.9  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2817  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.22 
 
 
582 aa  90.5  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0130426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  24.61 
 
 
510 aa  90.5  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  24.86 
 
 
514 aa  90.5  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.62 
 
 
596 aa  89.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  26.12 
 
 
487 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  24.67 
 
 
515 aa  89.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  26.12 
 
 
487 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1072  flavoprotein  26.35 
 
 
598 aa  88.6  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.208394  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  25.23 
 
 
599 aa  89  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.94 
 
 
628 aa  88.2  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  23.97 
 
 
521 aa  88.2  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2507  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.39 
 
 
602 aa  88.2  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  23.54 
 
 
519 aa  88.2  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  24.28 
 
 
483 aa  88.2  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  25.24 
 
 
596 aa  87.8  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0629  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.98 
 
 
599 aa  87.4  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.56075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  24.36 
 
 
500 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  24.62 
 
 
597 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  23.14 
 
 
517 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.55 
 
 
547 aa  86.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03720  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.13 
 
 
558 aa  86.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0571  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.25 
 
 
595 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  25.05 
 
 
596 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0437  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.33 
 
 
566 aa  84.7  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.95 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25020  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.83 
 
 
550 aa  84.3  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  24.47 
 
 
596 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  24.47 
 
 
596 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  24.47 
 
 
596 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  24.47 
 
 
596 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12690  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.61 
 
 
580 aa  83.2  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0342  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.18 
 
 
557 aa  83.2  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0195755  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.74 
 
 
510 aa  83.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  24.86 
 
 
596 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  22.63 
 
 
588 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  23.05 
 
 
598 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0182  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.58 
 
 
588 aa  82.8  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  23.76 
 
 
584 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2698  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.76 
 
 
591 aa  82.4  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.27 
 
 
576 aa  82  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  23.43 
 
 
517 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1547  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.23 
 
 
530 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129043  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  24.35 
 
 
494 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.92 
 
 
616 aa  81.6  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  27.78 
 
 
517 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  23.84 
 
 
589 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5210  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.18 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  22.45 
 
 
596 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  25.73 
 
 
515 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  23.66 
 
 
606 aa  79.7  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  24.66 
 
 
500 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0505  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.72 
 
 
597 aa  79.3  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.39 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>