More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0258 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  100 
 
 		 380 aa  772    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.73 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  38.26 
 
 		 365 aa  222  7e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  32.45 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  32.72 
 
 		 339 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  31.58 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  32.45 
 
 		 339 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  32.45 
 
 		 339 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 		 339 aa  175  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  32.45 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  34.96 
 
 		 338 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  35.26 
 
 		 241 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  33.99 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 		 260 aa  123  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  33.88 
 
 		 252 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  38.79 
 
 		 226 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  35.42 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  34.9 
 
 		 251 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.35 
 
 		 243 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  36.25 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 245 aa  106  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  33.83 
 
 		 226 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0418  ABC-2 type transporter  35.88 
 
 		 240 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  34.76 
 
 		 226 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  34.76 
 
 		 226 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  24.33 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 247 aa  96.3  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  25.9 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  23.41 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 366 aa  94.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.7 
 
 		 382 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  23.92 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 245 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  23.54 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 373 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 373 aa  90.5  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 		 241 aa  89.4  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.62 
 
 		 384 aa  89.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  23.29 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.34 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  26.2 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.06 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 376 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  23.98 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.56 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0438  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 245 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  22.25 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.09 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.04 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  23.9 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  25.32 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  27.88 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  27.44 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2579  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.763901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  22.43 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  23.2 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  22.08 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  22.03 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  20.37 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  21.22 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  19.13 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  22.03 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  23.99 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  21.87 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>