More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4326 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 463 aa  901    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  55.38 
 
 		 466 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  59.73 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  53.08 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  57.34 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  51.64 
 
 		 834 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2635  DNA-directed DNA polymerase  46.68 
 
 		 466 aa  300  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2771  DNA polymerase IV  47.74 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.259095  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  49.72 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  50.28 
 
 		 418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 418 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  50.14 
 
 		 418 aa  286  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  47.34 
 
 		 374 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  46.63 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  47.4 
 
 		 378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  47.4 
 
 		 378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3642  DNA polymerase IV  45.56 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  46.38 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  46.38 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11570  DNA polymerase IV  45.37 
 
 		 463 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3115  DNA polymerase IV  46.26 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  47.74 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  49.28 
 
 		 415 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0076  DNA-directed DNA polymerase  51.81 
 
 		 577 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3002  DNA-directed DNA polymerase  44.49 
 
 		 449 aa  276  6e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  49.44 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  49.57 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  44.96 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  47.2 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  48.35 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  49.7 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  45.38 
 
 		 359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  45.8 
 
 		 356 aa  266  7e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  46.29 
 
 		 386 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  38.07 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  41.83 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  42.52 
 
 		 358 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  45.14 
 
 		 408 aa  263  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  41.79 
 
 		 359 aa  262  8e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  46.2 
 
 		 380 aa  262  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  44.74 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  39.95 
 
 		 408 aa  262  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  44.82 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  47.55 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  43 
 
 		 417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  45.77 
 
 		 481 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  44.23 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  44.82 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  41.57 
 
 		 371 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  44.9 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  43.86 
 
 		 384 aa  257  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  48.99 
 
 		 422 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  43.93 
 
 		 369 aa  256  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  42.03 
 
 		 359 aa  255  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  40.4 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  42.57 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  46.29 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  45.72 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  44.31 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20590  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.74 
 
 		 489 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  41.72 
 
 		 359 aa  253  5.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  38.66 
 
 		 360 aa  252  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  47.81 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  43.8 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  42.13 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  46.86 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  42.03 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  39.09 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  39.09 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  42.43 
 
 		 417 aa  251  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  44.19 
 
 		 429 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  41.76 
 
 		 363 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  42.06 
 
 		 385 aa  249  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  41.91 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  42.9 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  42.9 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  42.86 
 
 		 429 aa  249  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  42.66 
 
 		 360 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  43.97 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  40.59 
 
 		 368 aa  247  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  41.32 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  36.48 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  42.11 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  41.5 
 
 		 371 aa  246  6e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  45.85 
 
 		 432 aa  246  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  38.71 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  40.35 
 
 		 365 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  43.02 
 
 		 432 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  42.53 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  42.69 
 
 		 412 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  40.46 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  40.94 
 
 		 391 aa  239  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  41.35 
 
 		 393 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  36.87 
 
 		 364 aa  239  8e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  41.57 
 
 		 435 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  42.65 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  42.77 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  40.64 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  44.31 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  38.81 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>