More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1055 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1055  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 372 aa  743    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  38.67 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0659  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100835  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 391 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 		 398 aa  99.4  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  22.93 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 		 367 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.5 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  22.13 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.06 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 		 419 aa  82.8  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  21.75 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  30.87 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  30.4 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.83 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  30.83 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  31.12 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.57 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  26.67 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 710 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.52 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 711 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.52 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  28.85 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.52 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  26.02 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  22.86 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  32.21 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.74 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.83 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  37.13 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  31.95 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  22.82 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  30 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 411 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  35.03 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  22.28 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  23.24 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>