More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0551 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0551  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 263 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.838284  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1733  regulatory protein GntR HTH  34.76 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  32.09 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1326  GntR domain protein  35.44 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  33.19 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1846  regulatory protein GntR, HTH  33.89 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  29.26 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  38.75 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  30.36 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  31.62 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  30.73 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  34.76 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  36.09 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  31.74 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  31.25 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  27.75 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  30.96 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  27.31 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  35.98 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  27.31 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.11 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.11 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  36.41 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5854  GntR domain protein  30.39 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.712492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  28.76 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  28.76 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  28.76 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  48.57 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6169  regulatory protein GntR HTH  32.89 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.398183 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  33.17 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  28.44 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.4 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5900  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.540308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  30 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  30.41 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  30 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  30 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 318 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  30 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  30 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  31.7 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  28.18 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  27.67 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  29.61 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  28.11 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  33.75 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  29.61 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  25.82 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.74 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.7 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3258  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.56 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  37.25 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186933 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02849  DNA-binding transcriptional dual regulator, glycolate-binding  31.56 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  31.56 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.56 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3440  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.56 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  32.21 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02799  hypothetical protein  31.56 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00647704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3153  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.56 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  26.13 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  31.11 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  26.09 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.77 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  29.53 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>