207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0307 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0307  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 583 aa  1163    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4858  glycoside hydrolase 15-related  54.67 
 
 		 597 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1183  glycoside hydrolase 15-related  52.61 
 
 		 616 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1076  glycoside hydrolase 15-related  50.7 
 
 		 594 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000337356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0382  glycoside hydrolase 15-related  52.14 
 
 		 611 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3690  glycoside hydrolase 15-related  52.33 
 
 		 593 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00190476  normal  0.0841535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2494  glycoside hydrolase 15-related  50 
 
 		 603 aa  477  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  32.88 
 
 		 602 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  33.05 
 
 		 602 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  32.54 
 
 		 600 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  31.09 
 
 		 599 aa  205  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  30.2 
 
 		 629 aa  204  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  31.33 
 
 		 850 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  32.61 
 
 		 596 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  32.17 
 
 		 614 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  30.68 
 
 		 596 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  32.1 
 
 		 605 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  31.89 
 
 		 596 aa  194  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  29.43 
 
 		 620 aa  194  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  31.82 
 
 		 601 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  30.1 
 
 		 619 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  30.1 
 
 		 619 aa  190  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  30.47 
 
 		 613 aa  189  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  29.61 
 
 		 617 aa  189  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  30.65 
 
 		 586 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  29.54 
 
 		 594 aa  187  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  31.55 
 
 		 600 aa  187  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  29.06 
 
 		 601 aa  187  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  30.43 
 
 		 602 aa  186  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  31.18 
 
 		 623 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  31.64 
 
 		 597 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  29.83 
 
 		 626 aa  184  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  31.36 
 
 		 602 aa  183  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  29.66 
 
 		 610 aa  183  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  29.9 
 
 		 602 aa  183  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  29.53 
 
 		 608 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  30.97 
 
 		 609 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  31.13 
 
 		 609 aa  180  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  32.39 
 
 		 598 aa  179  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  28.09 
 
 		 600 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  29.5 
 
 		 627 aa  179  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  28.55 
 
 		 605 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  30.24 
 
 		 626 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  30.79 
 
 		 609 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  30.46 
 
 		 611 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  29.48 
 
 		 605 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  29.73 
 
 		 598 aa  177  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  31.88 
 
 		 867 aa  177  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  30.14 
 
 		 593 aa  177  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  29.98 
 
 		 629 aa  177  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  29.98 
 
 		 623 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  29.71 
 
 		 628 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  28.24 
 
 		 627 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  30.13 
 
 		 659 aa  174  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  30.3 
 
 		 609 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  30.3 
 
 		 609 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  27.73 
 
 		 598 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  30.91 
 
 		 619 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  27.78 
 
 		 602 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  30.08 
 
 		 611 aa  170  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  30.13 
 
 		 609 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  30 
 
 		 603 aa  171  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  28.62 
 
 		 597 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  29.15 
 
 		 592 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  29.3 
 
 		 645 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  31.14 
 
 		 842 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  29.12 
 
 		 592 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  29.08 
 
 		 596 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  27.24 
 
 		 612 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  28.36 
 
 		 665 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  28.57 
 
 		 601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  29.75 
 
 		 632 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  30.64 
 
 		 604 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  28.55 
 
 		 610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  28.55 
 
 		 610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  30.25 
 
 		 844 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  28.14 
 
 		 619 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  28.55 
 
 		 610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  28.55 
 
 		 610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  28.55 
 
 		 610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  28.55 
 
 		 610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  28.55 
 
 		 610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  30.42 
 
 		 847 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  30.32 
 
 		 786 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  29.05 
 
 		 617 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  26.94 
 
 		 598 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  28.86 
 
 		 629 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  31.56 
 
 		 607 aa  163  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  29.58 
 
 		 601 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  29.75 
 
 		 621 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  26.86 
 
 		 626 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  27.78 
 
 		 609 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  28.6 
 
 		 623 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  31.32 
 
 		 617 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  30.42 
 
 		 589 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  29 
 
 		 613 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  28.86 
 
 		 617 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  28.09 
 
 		 662 aa  160  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  30.6 
 
 		 636 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  28.37 
 
 		 593 aa  159  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>