More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2389 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2389  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2975  Alpha/beta hydrolase  25 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  25.53 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1032  hypothetical protein  26.52 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.137185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  22.01 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.19 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  19.87 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  25.39 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.24 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  24.31 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  23.36 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.24 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.24 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1178  hypothetical protein  30.22 
 
 		 311 aa  65.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1184  hypothetical protein  30.77 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  24.23 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  24.23 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.19 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  22.55 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  24.71 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.47 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  24 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  28.3 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  24.33 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  41.12 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  23.81 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  25 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  22.68 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  22.3 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  22.84 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.97 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  24.69 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  21.28 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0318  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  25.81 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.91 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  23.98 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  23.85 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>