More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1617 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1617  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 465 aa  908    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27350  Major Facilitator Superfamily transporter  41.93 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5798  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 449 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172816  normal  0.0754795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0977  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.73 
 
 		 449 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3406  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 445 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0449  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0382  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0098676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1215  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 454 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3251  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0234  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 450 aa  196  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 439 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 439 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 439 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 439 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 439 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 439 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 472 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  26.48 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 433 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3301  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859152  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  26.9 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 452 aa  114  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  27.2 
 
 		 442 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  27.95 
 
 		 463 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  27.95 
 
 		 463 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  27.95 
 
 		 463 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  27.43 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  26.17 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  28.5 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1562  General substrate transporter  25.24 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503628  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  28.07 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  24.53 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  24.53 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  27.71 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  24.53 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  26.43 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  27.35 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 431 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  28.93 
 
 		 438 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  25.3 
 
 		 458 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  28.64 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.08 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  27.56 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  29 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  27.56 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1306  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099547  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  25.82 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  27.09 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  28.57 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 446 aa  108  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 437 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  26.87 
 
 		 443 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  24.88 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  24.88 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  24.88 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  27.35 
 
 		 489 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 439 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 439 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  27.01 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  27.46 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  27.46 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  30.1 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  25.23 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  26 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  26.3 
 
 		 531 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  26.75 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5794  general substrate transporter  28.71 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390402  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6639  general substrate transporter  28.51 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6159  general substrate transporter  28.71 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 485 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 485 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  26.21 
 
 		 485 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  25.75 
 
 		 465 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 485 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  25.86 
 
 		 485 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  25.36 
 
 		 500 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  25.86 
 
 		 485 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  25.36 
 
 		 500 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>