77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1497 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
242 aa  471  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  58.09 
 
 
249 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  57.26 
 
 
244 aa  234  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  53.94 
 
 
245 aa  232  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  51.87 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  51.04 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  47.52 
 
 
246 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  45.04 
 
 
246 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  45.04 
 
 
247 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  44.16 
 
 
237 aa  163  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  44.44 
 
 
246 aa  161  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  42.5 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  41.74 
 
 
253 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  39.92 
 
 
245 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  40.51 
 
 
245 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  41.25 
 
 
247 aa  148  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  38.91 
 
 
245 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  41.35 
 
 
245 aa  138  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  40.35 
 
 
234 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  37.3 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  41.1 
 
 
242 aa  135  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  37.08 
 
 
247 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  39.58 
 
 
247 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  35.71 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  35.98 
 
 
245 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  35.44 
 
 
245 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  36.71 
 
 
246 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  36.21 
 
 
245 aa  121  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  34.92 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  34.57 
 
 
245 aa  105  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  32.11 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  32.11 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  32.11 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  33.06 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  22.52 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  25.85 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  27.07 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  26.61 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
239 aa  55.1  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  28.21 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  24.39 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  23.83 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  26.29 
 
 
231 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  37.35 
 
 
262 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  24.79 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  29.91 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  37.35 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  37.35 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  18.78 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  31.15 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  22.55 
 
 
236 aa  48.9  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  22.22 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  22.13 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  25.44 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  18.6 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  21.15 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  26.5 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  23.53 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  21.46 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  23.2 
 
 
259 aa  45.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
250 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  30.39 
 
 
116 aa  45.4  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  26.51 
 
 
239 aa  45.4  0.0009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  26.85 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  31.25 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  23.72 
 
 
562 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  24.29 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  21.26 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  22.32 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  23.77 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  23.08 
 
 
562 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  42.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  22.37 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>