193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0930 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  49.57 
 
 		 211 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  35.66 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  39.31 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  34.32 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  34.92 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  40.74 
 
 		 305 aa  75.1  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  39.45 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  39.29 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  39.45 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  39.29 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  39.29 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  38.39 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  38.66 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  36.7 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  39.25 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  28.95 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  34.68 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  35.4 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  33.12 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 300 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  38.46 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  37.37 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  36.13 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  34.75 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  33.33 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  34.23 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  31.5 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  35.96 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  35.14 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  32.77 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1374  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  35.56 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  32.69 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  30.63 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  31.06 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  31.06 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  35.05 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  31.06 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  29.52 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  31.91 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  33.61 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  37 
 
 		 301 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1907  single-stranded DNA-binding protein  42.42 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  28.83 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  30.52 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  28.37 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4370  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  32.11 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  33.65 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  34.83 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  31.87 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  32.69 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  28.68 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  32.69 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  32.43 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  31.4 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>