108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0915 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  100 
 
 
222 aa  448  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  35.26 
 
 
200 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  34.39 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  40 
 
 
200 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.31 
 
 
203 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  35.81 
 
 
220 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  33.69 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  34.22 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.37 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.97 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  34.46 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  38.68 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  32.34 
 
 
232 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  24.74 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
199 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  30.22 
 
 
207 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  32.86 
 
 
400 aa  55.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  38.32 
 
 
262 aa  55.5  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  26.78 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  33.96 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
210 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  31.16 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  32 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  32 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  32 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
198 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
551 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
305 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
215 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  32.71 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  31.54 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  31.43 
 
 
575 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  34 
 
 
201 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  39.19 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  35.87 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  34.62 
 
 
205 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  34 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  34 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  30.77 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  34 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  34 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  34 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  26.83 
 
 
241 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  32.08 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1581  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000326286  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  34.48 
 
 
237 aa  45.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  33.09 
 
 
207 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4108  hypothetical protein  26.24 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4119  hypothetical protein  26.24 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0995588  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.85 
 
 
390 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.21 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  28.4 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4222  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  32.46 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  26.4 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  29.5 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  26.28 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  32.99 
 
 
306 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  35.56 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  29.29 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
267 aa  43.1  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  25.53 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.51 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4603  hypothetical protein  25.53 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.964338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3087  methyltransferase type 11  24.46 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  26.73 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4508  hypothetical protein  25.53 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4455  hypothetical protein  25.53 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.821165 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1519  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
274 aa  42.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  27.27 
 
 
285 aa  42.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 
257 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 
216 aa  42.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4457  hypothetical protein  25.53 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643189  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  29.41 
 
 
201 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  30.36 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  28.43 
 
 
192 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
269 aa  42.4  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
282 aa  42  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  34.83 
 
 
271 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
201 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1721  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 
277 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>