More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1581 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1581  methyltransferase type 11  100 
 
 
232 aa  473  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000326286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1149  methyltransferase type 12  37.18 
 
 
245 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  33.47 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  33.47 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
261 aa  71.6  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.79 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.19 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  26.34 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.17 
 
 
253 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.03 
 
 
253 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1384  methyltransferase type 11  27.81 
 
 
252 aa  62  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0223759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  27.1 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.92 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  27.61 
 
 
312 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.14 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  24.18 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.34 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  30.77 
 
 
629 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.89 
 
 
282 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  25 
 
 
268 aa  58.5  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.84 
 
 
258 aa  58.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.91 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  30.25 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  24.87 
 
 
413 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.94 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2133  methyltransferase type 12  24.26 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.153525  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.91 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4571  methyltransferase type 12  28.82 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.91 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  24.87 
 
 
413 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2506  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.93 
 
 
248 aa  56.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117869  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  25.97 
 
 
431 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 
247 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3841  Methyltransferase type 11  26.59 
 
 
243 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.12 
 
 
241 aa  55.5  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.04 
 
 
252 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
196 aa  55.5  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.77 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.63 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  27.74 
 
 
325 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  25.62 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  26.11 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  27.34 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.05 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  28.39 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
208 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  27.21 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0628  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.93 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308347  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.36 
 
 
253 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  30.1 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  30.1 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
201 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  25 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
201 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.07 
 
 
235 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 
220 aa  52.8  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
277 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
201 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  25.19 
 
 
262 aa  52.4  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.79 
 
 
253 aa  52.4  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
246 aa  52.4  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 
248 aa  52  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 
248 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.28 
 
 
253 aa  52  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  24.88 
 
 
223 aa  52  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.23 
 
 
245 aa  52  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00940  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  30.4 
 
 
344 aa  51.6  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.74 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  23.78 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4063  methyltransferase type 12  29.77 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.01 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  20.86 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4138  methyltransferase type 12  29.77 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.950968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  26.36 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  26.36 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  26.36 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  26.36 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.73 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  26.36 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  26.32 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  24.55 
 
 
305 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  27.82 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.27 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  26.36 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.81 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  21.55 
 
 
253 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  26.36 
 
 
220 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>