More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0238 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  100 
 
 		 323 aa  622  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  53.46 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  41.85 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  36.51 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  38.04 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  38.26 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  39.87 
 
 		 326 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  41.58 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  38.59 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0287  ROK family protein  37.46 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.490636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  34.04 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1710  ROK family protein  36.94 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  36.98 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  30.98 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  34.26 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.08 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  35.02 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  38.29 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  28.92 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  35.96 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  34.93 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  34.93 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  30.22 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  37.2 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  38.89 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  32.62 
 
 		 323 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  37.03 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  34.04 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  33.02 
 
 		 408 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  32.08 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  35.15 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  30.98 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.35 
 
 		 409 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  35.27 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  33.11 
 
 		 386 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  30.77 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  29.7 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.39 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  32.42 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  29.38 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  29.38 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  32.13 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  32.51 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  31.27 
 
 		 321 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  34.45 
 
 		 347 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  29.38 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  29 
 
 		 435 aa  112  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  34.07 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3538  ROK family protein  37.06 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  32.49 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.06 
 
 		 400 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  28.44 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  29.25 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  33.44 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  28.75 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  28.75 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  28.75 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  28.75 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  28.75 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  28.75 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  28.75 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  30.06 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  31.55 
 
 		 313 aa  110  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  29.6 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0297  ROK family protein  33.95 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  30.77 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  31.94 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  28.97 
 
 		 314 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.17 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.33 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  35.46 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  35.04 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  35.04 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.74 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  28.12 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.4 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.62 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.48 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  31.97 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  32.33 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  28.93 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  34.66 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  33.04 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  31.58 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  29.04 
 
 		 322 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  33.02 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  30.09 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  31.31 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  31.61 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  30.75 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  31.55 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1605  ROK family glucokinase  29.27 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.143197  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1639  ROK family glucokinase  29.27 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.352647  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  33.46 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.6 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  28.92 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  30.77 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>