More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2186 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  100 
 
 		 383 aa  757    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 483 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  37.99 
 
 		 588 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 991 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 473 aa  153  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 578 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 748 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  34.78 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 708 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 426 aa  126  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 1052 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 858 aa  123  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  35.62 
 
 		 582 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  28.31 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 729 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  29.86 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  29.34 
 
 		 337 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2158  histidine kinase  28.35 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.778679 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2243  histidine kinase  26.93 
 
 		 376 aa  106  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  32.94 
 
 		 559 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  30.74 
 
 		 265 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 663 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 450 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  31.47 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 739 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 654 aa  99.8  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2120  histidine kinase  33.77 
 
 		 384 aa  99.8  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.238176  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 1568 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  31.37 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 587 aa  89.7  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 574 aa  89.7  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  28.82 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1333  histidine kinase  29.41 
 
 		 515 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319012  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 603 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  31.25 
 
 		 557 aa  87  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 689 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 563 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 807 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 594 aa  81.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 655 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 1181 aa  81.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 1042 aa  80.1  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 579 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 625 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  26.89 
 
 		 588 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 531 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 659 aa  76.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.29 
 
 		 572 aa  76.3  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  30.2 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 763 aa  73.6  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 1329 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  27.12 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 734 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  25 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 628 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0162  sensor histidine kinase  26.2 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 841 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 593 aa  70.5  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 1195 aa  70.1  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 735 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  26.79 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.24 
 
 		 598 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1739  two-component sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 800 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 732 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 1252 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  29.72 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 732 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.16722  normal  0.0140597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.69 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 543 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0491  signal transduction histidine kinase-like protein  30 
 
 		 617 aa  67  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146334  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3251  sensor histidine kinase  26.4 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0198  sensor histidine kinase  26.4 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3435  sensor histidine kinase  26.4 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0188  sensor histidine kinase  26.4 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  25.72 
 
 		 683 aa  67  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2913  sensor histidine kinase  26.4 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340179  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2176  sensor histidine kinase  26.4 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 608 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 535 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>