More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0309 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  100 
 
 		 234 aa  457  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2845  GrpE protein  61.75 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2014  GrpE protein  60.13 
 
 		 361 aa  185  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0658  GrpE protein  57.95 
 
 		 410 aa  181  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1291  GrpE protein  49.14 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  36.65 
 
 		 282 aa  97.1  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  35.21 
 
 		 191 aa  92  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.67 
 
 		 194 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  30.33 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  36.42 
 
 		 180 aa  86.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  32.45 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.31 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  31.61 
 
 		 181 aa  85.9  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  36.24 
 
 		 192 aa  85.1  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  37.27 
 
 		 225 aa  85.1  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  39.26 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  35.92 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  37.5 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  31.82 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  35.97 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  32.74 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  36.69 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  32.4 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  36.23 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  30.34 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  31.06 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  30.12 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  33.74 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  31.06 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  31.12 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  33.33 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  35.03 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  33.33 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  32.28 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  33.56 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  32.61 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  29.33 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  32.37 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  30.63 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  32.52 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  32.85 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  32.47 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  33.96 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  31.18 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  30.43 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.42 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  30 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  30.43 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  31.21 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  31.75 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  31.84 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  30.92 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1359  GrpE protein  31.13 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  30.22 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  32.9 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  32.17 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  33.82 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  31.69 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  30 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  30 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 		 176 aa  72  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  32.35 
 
 		 218 aa  72  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  32.05 
 
 		 189 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  30.72 
 
 		 187 aa  72  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  31.37 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  35.46 
 
 		 212 aa  72  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  29.38 
 
 		 211 aa  72  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  29.83 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  29.25 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  31.06 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  32.08 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  35.67 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  31.43 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  27.78 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  32.48 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  28.98 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1570  GrpE protein  40.14 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145005  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  29.83 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  32.24 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  30.66 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  32.64 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  34.34 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  33.09 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  33.09 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  30.56 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  29.19 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.61 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  29.49 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.07 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  29.93 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>