87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4861 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013746  Htur_4861  integrase family protein  100 
 
 		 380 aa  785    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4632  integrase family protein  75.79 
 
 		 380 aa  595  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5046  integrase family protein  50.27 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4009  integrase family protein  35 
 
 		 373 aa  203  5e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5150  Site-specific recombinase XerD-like protein  38.48 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238574  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4353  hypothetical protein  33.25 
 
 		 379 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947426  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3240  integrase family protein  32.45 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3444  Site-specific recombinase XerD-like protein  35.14 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.862055  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3317  hypothetical protein  32.31 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.802831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2941  site-specific recombinase  33.23 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3395  hypothetical protein  33.11 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3406  site-specific recombinase  32.7 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  28.38 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  25.76 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  22.09 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.55 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.17 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  22.05 
 
 		 306 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.34 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  23.84 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  27.59 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.9 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  23.83 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  24.85 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.9 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.76 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.95 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.45 
 
 		 296 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.45 
 
 		 296 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.92 
 
 		 300 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  23.35 
 
 		 290 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4505  hypothetical protein  47.83 
 
 		 206 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  36.45 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.89 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  26.82 
 
 		 304 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  22.07 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  23.26 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  23.48 
 
 		 294 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  21.62 
 
 		 302 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  23.16 
 
 		 300 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  27.65 
 
 		 292 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.97 
 
 		 294 aa  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  23.08 
 
 		 314 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.8 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  22.93 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  21.83 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.38 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.34 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  26.77 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  21.08 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  25.55 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  21.43 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  34.48 
 
 		 292 aa  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  21.43 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  20.9 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  25.56 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  38.96 
 
 		 325 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  21.55 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  23.16 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  21.71 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.83 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  19.33 
 
 		 299 aa  46.6  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  24.2 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.73 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0669  integrase-recombinase  21.95 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  25.25 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  23.97 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  30.28 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  27.37 
 
 		 288 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.11 
 
 		 298 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  25.91 
 
 		 304 aa  43.9  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1900  phage integrase family protein  21.6 
 
 		 331 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125862  hitchhiker  0.00365877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  25.89 
 
 		 317 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  25.47 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6665  integrase family protein  21.49 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2090  integrase family protein  22.78 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.07 
 
 		 336 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  21.76 
 
 		 296 aa  43.1  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>