More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3503 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  80.33 
 
 
606 aa  1011    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  58.86 
 
 
588 aa  717    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  91.72 
 
 
604 aa  1146    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  56.95 
 
 
590 aa  694    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  54.77 
 
 
588 aa  635    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  60.64 
 
 
589 aa  728    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  100 
 
 
604 aa  1232    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  77.5 
 
 
610 aa  979    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  57.19 
 
 
584 aa  662    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  56.78 
 
 
589 aa  686    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  57.02 
 
 
589 aa  690    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  79.97 
 
 
609 aa  1011    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  54.1 
 
 
600 aa  654    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  49.08 
 
 
586 aa  611  1e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  49.67 
 
 
590 aa  595  1e-169  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  49.5 
 
 
590 aa  597  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  49.16 
 
 
590 aa  594  1e-168  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  48.91 
 
 
590 aa  588  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  47.67 
 
 
592 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  45.17 
 
 
595 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  46.1 
 
 
601 aa  549  1e-155  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  45.27 
 
 
590 aa  534  1e-150  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  44.52 
 
 
590 aa  530  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  44.19 
 
 
600 aa  527  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  43.14 
 
 
611 aa  525  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  42.74 
 
 
623 aa  526  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  43.14 
 
 
611 aa  525  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  45.02 
 
 
589 aa  524  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  44.19 
 
 
590 aa  520  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  42.79 
 
 
603 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  42.86 
 
 
600 aa  516  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  44.24 
 
 
604 aa  493  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0393541 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  42.35 
 
 
564 aa  418  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  25.68 
 
 
636 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  28.99 
 
 
555 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.29 
 
 
554 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  25.64 
 
 
568 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2434  ABC transporter related  27.02 
 
 
540 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  23.55 
 
 
620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.97 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  25.74 
 
 
530 aa  115  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.77 
 
 
589 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  23.85 
 
 
632 aa  112  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  23.47 
 
 
634 aa  112  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  23.23 
 
 
622 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  24.72 
 
 
643 aa  111  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  25.92 
 
 
545 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  27.39 
 
 
518 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  24.11 
 
 
639 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  28.21 
 
 
537 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.38 
 
 
555 aa  110  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  25.88 
 
 
540 aa  110  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.64 
 
 
553 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.4 
 
 
555 aa  110  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  27.09 
 
 
495 aa  110  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  27.65 
 
 
491 aa  110  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  26.94 
 
 
549 aa  110  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  22.22 
 
 
643 aa  110  8.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  23.87 
 
 
630 aa  110  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  23.92 
 
 
623 aa  109  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.9 
 
 
553 aa  109  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.67 
 
 
561 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.44 
 
 
578 aa  110  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.64 
 
 
553 aa  110  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02989  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.08 
 
 
555 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.67 
 
 
595 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.97 
 
 
555 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  24.85 
 
 
668 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2065  ABC transporter-related protein  26.68 
 
 
537 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004402  ABC transporter ATP-binding protein  27.06 
 
 
555 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485845  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  28.53 
 
 
532 aa  109  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  25.19 
 
 
543 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  25.78 
 
 
540 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.57 
 
 
555 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.45 
 
 
559 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.57 
 
 
555 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.57 
 
 
555 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.57 
 
 
555 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.57 
 
 
555 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  24.9 
 
 
647 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.57 
 
 
555 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  25.91 
 
 
569 aa  108  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.98 
 
 
556 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.47 
 
 
547 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.36 
 
 
558 aa  107  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1611  ABC transporter related  28.17 
 
 
460 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  27.49 
 
 
566 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  25.1 
 
 
634 aa  107  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  22.74 
 
 
627 aa  107  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  24.27 
 
 
656 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  27.26 
 
 
632 aa  107  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  28.91 
 
 
547 aa  107  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  25.59 
 
 
540 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  26.86 
 
 
629 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  25 
 
 
631 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  25.51 
 
 
653 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  25.05 
 
 
634 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  23.56 
 
 
629 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  26.23 
 
 
593 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.06 
 
 
555 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>