136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2693 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2693  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
451 aa  912    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
795 aa  76.6  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  25.65 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
963 aa  74.3  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  26.03 
 
 
475 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  23.7 
 
 
431 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
861 aa  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  27.85 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 
687 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  26.21 
 
 
1454 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  26.21 
 
 
463 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  25.42 
 
 
352 aa  60.1  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  27.81 
 
 
461 aa  60.1  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  34.86 
 
 
581 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 
382 aa  58.9  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0160  Pyrrolo-quinoline quinone  29.5 
 
 
471 aa  57  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0726185  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  28.04 
 
 
450 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  24.52 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  24.42 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  30.94 
 
 
727 aa  54.7  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.94 
 
 
589 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.94 
 
 
588 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  23.36 
 
 
371 aa  53.9  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3410  Pyrrolo-quinoline quinone  26.46 
 
 
398 aa  53.9  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  24.44 
 
 
653 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.02 
 
 
587 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.02 
 
 
587 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.02 
 
 
587 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  23.05 
 
 
423 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  23.53 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  22.43 
 
 
809 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  25.16 
 
 
397 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  26.85 
 
 
603 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  28.36 
 
 
709 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0204  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  33.16 
 
 
555 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  29.63 
 
 
631 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.22 
 
 
587 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  29.63 
 
 
620 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  29.63 
 
 
631 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  23.3 
 
 
652 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  27.34 
 
 
588 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  29.58 
 
 
705 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  31.34 
 
 
705 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  29.6 
 
 
438 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 
774 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  25.51 
 
 
583 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1327  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  32.76 
 
 
423 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  27.62 
 
 
445 aa  50.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  23.85 
 
 
1067 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2569  Pyrrolo-quinoline quinone  29.41 
 
 
531 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  27.81 
 
 
1009 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  32.41 
 
 
591 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 
623 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  29.63 
 
 
631 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 
623 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.97 
 
 
597 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  29.09 
 
 
587 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  22.22 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.78 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.86 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.78 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.78 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 
603 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  23.86 
 
 
453 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.88 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  25.14 
 
 
371 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  28.26 
 
 
580 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  22.09 
 
 
1300 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  31.96 
 
 
580 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0476  quinoprotein alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
618 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260666 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.99 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.56 
 
 
392 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  24.21 
 
 
575 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.28 
 
 
1383 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  25.53 
 
 
392 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  34.78 
 
 
593 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  26.03 
 
 
579 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.53 
 
 
392 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.53 
 
 
392 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.53 
 
 
392 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.53 
 
 
392 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2894  Pyrrolo-quinoline quinone  23.64 
 
 
406 aa  47.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0786698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  23.94 
 
 
374 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  25.53 
 
 
392 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.84 
 
 
395 aa  47.4  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  25.11 
 
 
422 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  33.64 
 
 
426 aa  47.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.53 
 
 
392 aa  47.4  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  24.34 
 
 
387 aa  47  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  25.14 
 
 
371 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3315  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28 
 
 
557 aa  47  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  24.54 
 
 
611 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  23.03 
 
 
2272 aa  46.6  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  29.32 
 
 
441 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  31.39 
 
 
901 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.84 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.84 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.84 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.84 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>