More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4458 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 640 aa  1316    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  43.94 
 
 		 636 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  45.32 
 
 		 619 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  38.32 
 
 		 481 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.43 
 
 		 495 aa  330  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.9 
 
 		 493 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  37.76 
 
 		 492 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  37.76 
 
 		 492 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  37.76 
 
 		 492 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  36.71 
 
 		 492 aa  322  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  38.11 
 
 		 487 aa  321  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  37.17 
 
 		 492 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  37.37 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  36.55 
 
 		 492 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  36.53 
 
 		 493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  38.46 
 
 		 492 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  38.01 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.96 
 
 		 497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  37.68 
 
 		 509 aa  307  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  37.37 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  35.69 
 
 		 498 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  35.48 
 
 		 494 aa  301  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  39.42 
 
 		 478 aa  301  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  39.23 
 
 		 492 aa  299  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  37.55 
 
 		 487 aa  297  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  34.56 
 
 		 495 aa  296  8e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  38.31 
 
 		 478 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  37.9 
 
 		 491 aa  295  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  37.21 
 
 		 476 aa  293  8e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  36.15 
 
 		 502 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  35.98 
 
 		 502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.06 
 
 		 502 aa  283  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  35.48 
 
 		 479 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  34.07 
 
 		 503 aa  279  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  34.78 
 
 		 477 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  33.95 
 
 		 477 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  33.67 
 
 		 477 aa  266  8.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  34.95 
 
 		 477 aa  260  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  35.54 
 
 		 500 aa  250  5e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  25.53 
 
 		 513 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  24.75 
 
 		 517 aa  104  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  23.46 
 
 		 519 aa  99  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  40.3 
 
 		 142 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  39.55 
 
 		 142 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  28.31 
 
 		 519 aa  92.8  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  26.71 
 
 		 571 aa  91.7  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  28.86 
 
 		 514 aa  91.7  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  37.31 
 
 		 143 aa  91.3  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  35.82 
 
 		 142 aa  88.6  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  40.16 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  43.75 
 
 		 166 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  35.66 
 
 		 210 aa  82  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  40.77 
 
 		 146 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  40.77 
 
 		 146 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  40.77 
 
 		 146 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  38.28 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  38.28 
 
 		 223 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 		 140 aa  77  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  32.84 
 
 		 147 aa  75.1  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  30.86 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  37.59 
 
 		 215 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  39.23 
 
 		 216 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  33.54 
 
 		 169 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 		 152 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  36.23 
 
 		 219 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 202 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  37.01 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  37.21 
 
 		 216 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  37.21 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  36.59 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  40 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  35.38 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  36.72 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  34.59 
 
 		 140 aa  67  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  31.01 
 
 		 221 aa  66.6  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  36.09 
 
 		 212 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 211 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  35.04 
 
 		 138 aa  66.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 143 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  33.86 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 143 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  39.37 
 
 		 225 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  34.88 
 
 		 143 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.66 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 143 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  35.2 
 
 		 141 aa  65.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  38.64 
 
 		 162 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 136 aa  65.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  37.6 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 143 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  36.09 
 
 		 212 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  39.37 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  39.37 
 
 		 145 aa  65.1  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 		 145 aa  65.1  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  34.43 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  31.54 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  31.54 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  31.54 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>