176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3377 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 440 aa  865    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  38.84 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  31.51 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  31.77 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  32.68 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4131  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 413 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.08 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.27 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.99 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  22.76 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  25.32 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  19.77 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  24.03 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  23.45 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  25.1 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  24.47 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  24.47 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  24.47 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  21.92 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  23.85 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  24.05 
 
 		 381 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 		 281 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  22.75 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  21.36 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  21.67 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  21.51 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  22.02 
 
 		 369 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  23.43 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  28.57 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  22.82 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.32 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  24.84 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6205  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.261883 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  21.85 
 
 		 339 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.56 
 
 		 384 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2551  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 508 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.644772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  24.27 
 
 		 383 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 374 aa  53.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  23.66 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  30.6 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 367 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  22.25 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  24.67 
 
 		 374 aa  50.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 378 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 376 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 		 370 aa  50.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 375 aa  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  28.88 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  21.64 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  30.17 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  22.22 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  23.04 
 
 		 901 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  26.7 
 
 		 374 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  20.69 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  30.17 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 369 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.7 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  26.7 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  22.73 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  26.7 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  28.89 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  23.08 
 
 		 373 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16770  ABC-2 type transporter, permease component  22.56 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00841824  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 370 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  26.7 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  26.7 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  23.39 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  20.97 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  23.53 
 
 		 385 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6993  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 268 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  19.21 
 
 		 365 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>