45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3031 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  51.07 
 
 		 234 aa  232  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  52.19 
 
 		 243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  49.57 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  44.98 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  43.48 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  51.29 
 
 		 236 aa  207  9e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  45.65 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  49.79 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  43.11 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  47.64 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  47.62 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  44.21 
 
 		 234 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  42.02 
 
 		 243 aa  184  9e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  46.58 
 
 		 236 aa  184  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  47.44 
 
 		 237 aa  171  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  44.12 
 
 		 550 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  43.44 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  41.94 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  40.89 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  27.02 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  28.39 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  26.5 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  30.17 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  27 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  22.84 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  29.11 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  26.32 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  28.32 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  26.77 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  27.68 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  23.53 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  31.11 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  31.68 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  24.86 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  29.91 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  25.58 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  24.31 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  33.72 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  26.97 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  28.57 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  22.42 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  27.86 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  27.86 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  27.86 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>