More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2079 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2079  putative sensor with HAMP domain protein  100 
 
 
509 aa  1010    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
699 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.41 
 
 
1212 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
1397 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  31.27 
 
 
1361 aa  94.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  26.15 
 
 
642 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
1362 aa  87.4  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 
699 aa  87.4  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.1 
 
 
677 aa  87  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0173542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.16 
 
 
695 aa  86.7  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1661  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  29.17 
 
 
622 aa  85.9  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.09 
 
 
695 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.37 
 
 
681 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5162  methyl-accepting chemotaxis protein  26.85 
 
 
666 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
683 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.853209  hitchhiker  0.00641465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.81 
 
 
639 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
628 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1766  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.91 
 
 
591 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1349  sensor protein  22.78 
 
 
574 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0628361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3112  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.57 
 
 
1029 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
646 aa  73.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2549  methyl-accepting chemotaxis protein  23.38 
 
 
699 aa  73.6  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0016673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  26.33 
 
 
604 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4739  methyl-accepting chemotaxis protein  25.45 
 
 
666 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.94 
 
 
604 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.11 
 
 
684 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.62 
 
 
659 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5124  methyl-accepting chemotaxis protein  25 
 
 
669 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4882  methyl-accepting chemotaxis protein  25 
 
 
666 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4724  methyl-accepting chemotaxis protein  25 
 
 
666 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1076  sensor protein  35.11 
 
 
630 aa  72  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5256  methyl-accepting chemotaxis protein  25 
 
 
666 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594583  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1055  diguanylate cyclase  23.11 
 
 
598 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  25 
 
 
666 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5156  methyl-accepting chemotaxis protein  24.52 
 
 
666 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4649  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.97 
 
 
653 aa  70.5  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.38 
 
 
667 aa  70.1  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  28.22 
 
 
705 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  23.51 
 
 
574 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.59 
 
 
664 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0344435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0545  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  25.77 
 
 
676 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25556e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  24.04 
 
 
666 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 
611 aa  67  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.85 
 
 
823 aa  67  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.35 
 
 
657 aa  67  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.94 
 
 
819 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636482  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3880  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  24.13 
 
 
680 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  28.51 
 
 
612 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0178  methyl-accepting chemotaxis protein  25.51 
 
 
696 aa  65.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000210736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4013  methyl-accepting chemotaxis protein  28.96 
 
 
756 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.36 
 
 
666 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4841  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.52 
 
 
666 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  26.21 
 
 
581 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.23 
 
 
788 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.925334  normal  0.122382 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.67 
 
 
661 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  27.52 
 
 
810 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 
654 aa  64.7  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706955  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  36.7 
 
 
1128 aa  64.7  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  23.08 
 
 
678 aa  64.7  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 
1465 aa  64.3  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2151  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.07 
 
 
656 aa  63.9  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4149  diguanylate cyclase  25.74 
 
 
591 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0015025  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.5 
 
 
631 aa  63.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.23 
 
 
630 aa  63.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  29.37 
 
 
730 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  22.42 
 
 
788 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.1 
 
 
650 aa  62.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0298  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.09 
 
 
749 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
680 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  32.09 
 
 
1111 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3269  sensor protein  34.07 
 
 
619 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.72 
 
 
663 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.113755  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
792 aa  61.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  23.79 
 
 
660 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 
658 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
639 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  23.79 
 
 
660 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.51 
 
 
995 aa  61.2  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3671  putative signaling protein  27.12 
 
 
480 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 
817 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  25.78 
 
 
626 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0458  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.87 
 
 
726 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.386076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 
817 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  23.79 
 
 
660 aa  60.5  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  25.41 
 
 
1133 aa  60.1  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
873 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0030  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.91 
 
 
660 aa  60.1  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.136855  normal  0.0162002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  29.57 
 
 
645 aa  60.1  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
682 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.38 
 
 
658 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.66 
 
 
686 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2469  histidine kinase, HAMP region  30.07 
 
 
269 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.521658  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.23 
 
 
655 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  33 
 
 
644 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1002  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  24.02 
 
 
1100 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  26.34 
 
 
937 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
1021 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.94 
 
 
1177 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.09 
 
 
773 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.77 
 
 
1260 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>