200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1653 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
377 aa  745    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  42.5 
 
 
350 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  41.02 
 
 
353 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  39.88 
 
 
344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  37.81 
 
 
357 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  39.94 
 
 
362 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  36.2 
 
 
352 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  37.69 
 
 
379 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  38.87 
 
 
361 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  35.47 
 
 
363 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  36.12 
 
 
351 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  35.4 
 
 
355 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 
355 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  34.81 
 
 
355 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  35.09 
 
 
355 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  35.4 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  36.47 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  34.51 
 
 
355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  36.47 
 
 
356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  35.09 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  37.88 
 
 
357 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 
355 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  37.69 
 
 
348 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  37.8 
 
 
348 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.65 
 
 
815 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  33.05 
 
 
354 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  30.89 
 
 
354 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  35.43 
 
 
358 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  32.1 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  31.67 
 
 
429 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  29.36 
 
 
403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  30.15 
 
 
355 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  34.88 
 
 
359 aa  175  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  32.97 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.83 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  32.07 
 
 
358 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  31.94 
 
 
876 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  27.3 
 
 
370 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  31.79 
 
 
358 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  36.68 
 
 
349 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  31.79 
 
 
358 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  35.14 
 
 
339 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  31.79 
 
 
358 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  31.79 
 
 
358 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  31.79 
 
 
358 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  32.69 
 
 
349 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  36.65 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  35.98 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  35.1 
 
 
315 aa  166  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  35.43 
 
 
356 aa  162  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  34.82 
 
 
341 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  34.87 
 
 
347 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
353 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  34.48 
 
 
344 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  31.69 
 
 
355 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  34.67 
 
 
348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  32.88 
 
 
338 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  30.95 
 
 
344 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  32.33 
 
 
362 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
353 aa  149  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 
353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  34.43 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  29.86 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  32.17 
 
 
344 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  30.95 
 
 
344 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  32.03 
 
 
351 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  32.22 
 
 
365 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  32.24 
 
 
451 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  32.13 
 
 
339 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  31.31 
 
 
354 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  26.16 
 
 
344 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  27.53 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  32.06 
 
 
360 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  31 
 
 
340 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  31.96 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  31.96 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  31.96 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  32.18 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  32 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  29.69 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  29.92 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  30.81 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  28.97 
 
 
354 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  30.23 
 
 
353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  30.81 
 
 
342 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  28.19 
 
 
339 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  28.23 
 
 
358 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  28.39 
 
 
358 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  29.58 
 
 
353 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 
345 aa  123  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  27.57 
 
 
362 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  27.57 
 
 
362 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  28.65 
 
 
352 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  29.75 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  28.89 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  29.08 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>