94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0313 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0313  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 497 aa  1001    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1424  Extracellular ligand-binding receptor  36.36 
 
 		 517 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 		 449 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  26.73 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  24.51 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  27.85 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 		 425 aa  67  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0110  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  26.95 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  29.76 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  35.43 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  24.87 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  31.78 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  37.08 
 
 		 394 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  24.61 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 		 424 aa  53.5  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  32.19 
 
 		 391 aa  53.5  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  35.63 
 
 		 394 aa  53.5  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  28.82 
 
 		 373 aa  53.5  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.63 
 
 		 394 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.54 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 		 374 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 		 373 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2642  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 795 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3474  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 795 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  25.36 
 
 		 373 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  22.55 
 
 		 439 aa  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.57 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 824 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 370 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3090  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.989636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 371 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3096  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  27.47 
 
 		 373 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 		 378 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 371 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 		 376 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  24.07 
 
 		 422 aa  47.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 		 387 aa  47.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  23.95 
 
 		 381 aa  47.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 		 394 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  26.52 
 
 		 367 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1489  Legumain  27.81 
 
 		 741 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.26033 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  21.79 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03309  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  25.97 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1670  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00502897  hitchhiker  0.00000000193878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3659  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  25.97 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0256  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03262  hypothetical protein  25.97 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  28.89 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2659  extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 		 752 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0255  Extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 		 367 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3879  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  26.78 
 
 		 367 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3942  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  25.97 
 
 		 367 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3759  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  26.78 
 
 		 367 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4780  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  25.97 
 
 		 367 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3836  leucine-specific-binding protein  26.78 
 
 		 365 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1736  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.34 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3743  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  25.97 
 
 		 367 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 		 439 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3938  leucine-specific-binding protein  26.78 
 
 		 367 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3769  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  26.78 
 
 		 365 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2831  substrate-binding protein, putative  25.56 
 
 		 375 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00332473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  27.53 
 
 		 368 aa  43.5  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 		 426 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 		 380 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 		 393 aa  43.5  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 		 373 aa  43.5  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4059  Extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 		 370 aa  43.5  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>