More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3096 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3096  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
411 aa  827    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3006  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
407 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  34.75 
 
 
384 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  32.8 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0585  Extracellular ligand-binding receptor  35.09 
 
 
453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  32.7 
 
 
401 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  31.97 
 
 
400 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.82 
 
 
402 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 
412 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  32.79 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  32.43 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  31.57 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  32.61 
 
 
384 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  32.61 
 
 
384 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.14 
 
 
384 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.73 
 
 
380 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  32.53 
 
 
381 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  31.08 
 
 
401 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  31.82 
 
 
381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  32.26 
 
 
384 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  32.26 
 
 
384 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 
380 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  32.34 
 
 
384 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  31.9 
 
 
336 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  31.81 
 
 
380 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  31.81 
 
 
380 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.81 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  31.2 
 
 
393 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.81 
 
 
380 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.81 
 
 
380 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.81 
 
 
380 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.81 
 
 
380 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  31.81 
 
 
380 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.81 
 
 
380 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.81 
 
 
380 aa  136  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  31.47 
 
 
380 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  31.47 
 
 
391 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  31.47 
 
 
391 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  32.17 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 
383 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2648  Extracellular ligand-binding receptor  32.63 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  32.07 
 
 
381 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 
373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 
373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.44 
 
 
378 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.44 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.44 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  31.44 
 
 
372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  31.44 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.44 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.44 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
383 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 
814 aa  129  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2032  extracellular ligand-binding receptor  31.18 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  29.76 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  30.63 
 
 
382 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  30.96 
 
 
399 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.17 
 
 
377 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.43 
 
 
399 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  28.88 
 
 
375 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 
376 aa  125  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
394 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2037  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
403 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 
400 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  31.18 
 
 
383 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  30.62 
 
 
373 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
389 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1205  extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 
384 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000303202  normal  0.322412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  30.71 
 
 
399 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 
390 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
383 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1892  extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 
422 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.130266  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  28.13 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  28.97 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.63 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2975  extracellular ligand-binding receptor  30.52 
 
 
419 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.225754  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.68 
 
 
383 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1636  extracellular ligand-binding receptor  31.93 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0385235  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1435  extracellular ligand-binding receptor  30.6 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0735342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  30.91 
 
 
372 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 
376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3401  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 
379 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.388266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2810  extracellular ligand-binding receptor  28.87 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.079562  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  29.56 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  31 
 
 
378 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 
381 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  29.12 
 
 
401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  31.85 
 
 
383 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>