More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3006 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3006  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
407 aa  824    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2032  extracellular ligand-binding receptor  51.45 
 
 
418 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0585  Extracellular ligand-binding receptor  48.97 
 
 
453 aa  346  5e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2863  Extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 
412 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3096  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
411 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2975  extracellular ligand-binding receptor  31.22 
 
 
419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.225754  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1892  extracellular ligand-binding receptor  32.12 
 
 
422 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.130266  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 
814 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  32.69 
 
 
401 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  32.69 
 
 
401 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 
371 aa  143  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  33.11 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
399 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  33.44 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  32.17 
 
 
380 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  34.04 
 
 
401 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.58 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  31.19 
 
 
399 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.89 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 
384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.46 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 
384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 
384 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 
393 aa  129  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 
384 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 
381 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.03 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.79 
 
 
380 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 
384 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  31.56 
 
 
370 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.41 
 
 
376 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  32.62 
 
 
398 aa  126  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.48 
 
 
380 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  28.48 
 
 
380 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.48 
 
 
380 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.41 
 
 
378 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.48 
 
 
380 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.48 
 
 
380 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.25 
 
 
402 aa  126  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.48 
 
 
380 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  30.25 
 
 
381 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 
399 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 
381 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.09 
 
 
380 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.09 
 
 
380 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.09 
 
 
380 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  31.11 
 
 
369 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.25 
 
 
373 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  30.09 
 
 
380 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.09 
 
 
380 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  30.09 
 
 
372 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 
380 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 
383 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.77 
 
 
380 aa  123  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  31.15 
 
 
372 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 
380 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  27.53 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  32.25 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  32.25 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  32.25 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  29.77 
 
 
380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  29.77 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.76 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  29.77 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  29.77 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 
384 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
376 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  33.55 
 
 
388 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  32.25 
 
 
379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6859  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278676  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  32.25 
 
 
379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.25 
 
 
379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  28.04 
 
 
373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.25 
 
 
375 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  26.96 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 
386 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  32.61 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0597  extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.06 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 
382 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  32.61 
 
 
379 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 
373 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  32.25 
 
 
379 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 
373 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  30.82 
 
 
382 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  30.19 
 
 
374 aa  117  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2957  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 
391 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
382 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.37 
 
 
515 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 
382 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>