More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0166 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0166  aconitate hydratase domain protein  100 
 
 		 659 aa  1349    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4646  3-isopropylmalate dehydratase  40.61 
 
 		 655 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715504  normal  0.524073 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1455  aconitate hydratase domain protein  38.66 
 
 		 646 aa  412  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6199  3-isopropylmalate dehydratase  38.89 
 
 		 653 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0449269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  34.96 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  32.3 
 
 		 642 aa  209  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  32.59 
 
 		 418 aa  208  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.87 
 
 		 431 aa  203  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5868  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.91 
 
 		 440 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  33.55 
 
 		 432 aa  200  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  32.97 
 
 		 422 aa  198  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  32.54 
 
 		 431 aa  197  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  32.52 
 
 		 418 aa  196  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.95 
 
 		 431 aa  193  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.48 
 
 		 415 aa  193  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  31.1 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  32.82 
 
 		 417 aa  189  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1900  3-isopropylmalate dehydratase  31.25 
 
 		 431 aa  188  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  32.61 
 
 		 655 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  34.29 
 
 		 418 aa  187  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.55 
 
 		 420 aa  187  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  30.75 
 
 		 642 aa  187  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0737  homoaconitate hydratase family protein  33.05 
 
 		 431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  32.45 
 
 		 416 aa  185  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4843  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.36 
 
 		 435 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0110  homoaconitate hydratase family protein  29.28 
 
 		 435 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  31.65 
 
 		 418 aa  183  7e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5387  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.96 
 
 		 434 aa  183  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.37135  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.24 
 
 		 418 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  30.38 
 
 		 643 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  30.38 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  31.65 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  30.92 
 
 		 642 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2175  homoaconitate hydratase family protein  31.9 
 
 		 431 aa  182  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  34.66 
 
 		 420 aa  182  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.5 
 
 		 418 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  34 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.52 
 
 		 420 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.02 
 
 		 418 aa  181  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1136  isopropylmalate isomerase large subunit  32.29 
 
 		 468 aa  180  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.02 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1722  homoaconitate hydratase family protein  32.11 
 
 		 432 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2728  homoaconitate hydratase family protein  30.8 
 
 		 439 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  31.47 
 
 		 471 aa  178  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  31.43 
 
 		 416 aa  177  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.98 
 
 		 418 aa  177  5e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  30.62 
 
 		 418 aa  177  7e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  30.6 
 
 		 431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2159  3-isopropylmalate dehydratase  32.6 
 
 		 398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.219475 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  30.18 
 
 		 661 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.5 
 
 		 424 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.72 
 
 		 428 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.04 
 
 		 425 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.85 
 
 		 424 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  32.47 
 
 		 645 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  32.47 
 
 		 645 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  30.99 
 
 		 437 aa  172  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1949  homoaconitate hydratase family protein  32.53 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  31.36 
 
 		 429 aa  171  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.97 
 
 		 415 aa  171  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  30.29 
 
 		 472 aa  171  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.35 
 
 		 423 aa  171  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.65 
 
 		 427 aa  171  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.65 
 
 		 427 aa  171  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  30.26 
 
 		 657 aa  170  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  31.45 
 
 		 677 aa  170  6e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.41 
 
 		 424 aa  170  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  31.15 
 
 		 474 aa  170  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  30.24 
 
 		 419 aa  169  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0798  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.52 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.963683  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.71 
 
 		 419 aa  169  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31 
 
 		 427 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.44 
 
 		 429 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.02 
 
 		 427 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0476  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.25 
 
 		 431 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146744  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3334  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.58 
 
 		 472 aa  168  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1850  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.43 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.75 
 
 		 424 aa  167  5e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3159  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.87 
 
 		 431 aa  167  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000477252  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  28.17 
 
 		 644 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.81 
 
 		 427 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  30.35 
 
 		 639 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.11 
 
 		 424 aa  167  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  29.79 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  29.79 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.75 
 
 		 419 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  29.79 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0849  isopropylmalate isomerase large subunit  30.94 
 
 		 467 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  30.31 
 
 		 417 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.51 
 
 		 417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2680  isopropylmalate isomerase large subunit  32.82 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1906  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.03 
 
 		 426 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0606993  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  28.98 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  30.09 
 
 		 655 aa  164  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2211  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.96 
 
 		 419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00871543  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  29.93 
 
 		 415 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0828  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.44 
 
 		 416 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.16 
 
 		 421 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.51 
 
 		 417 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3165  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.48 
 
 		 427 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.770733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>