269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1973 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
239 aa  497  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  40.94 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  40.94 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  31.38 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  40.52 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  40.14 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  34.22 
 
 
226 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  37.84 
 
 
210 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  35.76 
 
 
210 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  37.84 
 
 
210 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  37.84 
 
 
210 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  36.88 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  35.5 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  38.65 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  37.41 
 
 
213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  38.04 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  36.09 
 
 
211 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  34.32 
 
 
204 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 
211 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  31.25 
 
 
214 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 
214 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  35.53 
 
 
217 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  36.24 
 
 
203 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  33.73 
 
 
216 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  38.69 
 
 
224 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  41.94 
 
 
211 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  28.82 
 
 
210 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 
197 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  39.42 
 
 
185 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.96 
 
 
210 aa  98.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  35.22 
 
 
199 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  34.23 
 
 
191 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  32.3 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  37.4 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 
211 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  35.37 
 
 
200 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 
211 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 
210 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  28.99 
 
 
216 aa  95.9  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 
210 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  31.63 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  32.24 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  31.16 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  39.53 
 
 
201 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  31.63 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  40.46 
 
 
205 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  35.12 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  35.12 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  33.6 
 
 
291 aa  92.4  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  35.12 
 
 
191 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  34.27 
 
 
197 aa  92  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 
205 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 
205 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 
181 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 
181 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 
205 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 
205 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  34.15 
 
 
205 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  32.7 
 
 
199 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  33.54 
 
 
181 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  32.12 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  32.84 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  34.93 
 
 
197 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  37.98 
 
 
198 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  38.94 
 
 
208 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 
204 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  34.56 
 
 
192 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 
196 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  34.01 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 
205 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 
205 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  37.88 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
205 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  32.48 
 
 
194 aa  86.3  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  33.83 
 
 
200 aa  85.9  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  35.17 
 
 
219 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  33.83 
 
 
200 aa  85.9  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 
187 aa  85.5  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  31.28 
 
 
205 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  29.33 
 
 
310 aa  85.5  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  32.39 
 
 
204 aa  85.5  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  34.21 
 
 
200 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  34.75 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 
203 aa  85.1  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  34.75 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  34.35 
 
 
209 aa  85.1  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  36.89 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
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NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  32.16 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
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NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  34.75 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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