86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0727 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
302 aa  619  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  31.79 
 
 
321 aa  135  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  32.88 
 
 
327 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  28.23 
 
 
323 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  31.27 
 
 
316 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  31.85 
 
 
318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  31.21 
 
 
352 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  30.58 
 
 
317 aa  112  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  29.58 
 
 
357 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  29.58 
 
 
357 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  31.74 
 
 
318 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  29.01 
 
 
344 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  30.87 
 
 
326 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  27.4 
 
 
315 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  28.9 
 
 
316 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  28.48 
 
 
339 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  25.25 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  30.07 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  28.85 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  30.56 
 
 
346 aa  92  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  23.23 
 
 
337 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  26.4 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  27.57 
 
 
341 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  26.4 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  26.32 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  27.57 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  26.42 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  23.65 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  24.75 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  23.99 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  25.33 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  27.46 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  26.01 
 
 
943 aa  76.6  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  26.94 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  29.67 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  25.74 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  21.93 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  28.34 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  23.43 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  24.05 
 
 
417 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  21.71 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  24.32 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  26.47 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  24.32 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  23.78 
 
 
372 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  24.68 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  27.91 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  25.79 
 
 
362 aa  62.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  22.88 
 
 
374 aa  62.8  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  27.21 
 
 
329 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  26.03 
 
 
294 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  25.96 
 
 
380 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  26.09 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  27.83 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  23.51 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  21.85 
 
 
299 aa  56.6  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  22.86 
 
 
267 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  25.64 
 
 
365 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
444 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  25.46 
 
 
365 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  24.04 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  25.83 
 
 
365 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  25.46 
 
 
365 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  25.83 
 
 
365 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  28.19 
 
 
430 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  23.65 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  21.66 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  25.32 
 
 
361 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  25.17 
 
 
361 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  24.83 
 
 
361 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  23.2 
 
 
384 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  27.52 
 
 
454 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  28.99 
 
 
430 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1093  conserved repeat domain protein  29.23 
 
 
445 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.396809  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  27.14 
 
 
412 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
437 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  23.6 
 
 
412 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  31.97 
 
 
430 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  27.86 
 
 
444 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  28.78 
 
 
441 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  21.23 
 
 
552 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  25.71 
 
 
430 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 
473 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  25.67 
 
 
398 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  25 
 
 
444 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>