More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3415 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
390 aa  732    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  51.92 
 
 
391 aa  320  3e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
394 aa  312  6.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  49.06 
 
 
390 aa  296  6e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  46.41 
 
 
414 aa  285  9e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  46.65 
 
 
390 aa  280  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  47.27 
 
 
390 aa  279  6e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 
390 aa  277  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 
407 aa  109  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
394 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
398 aa  99.8  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
400 aa  97.1  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 
412 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
409 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  25.45 
 
 
440 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  25 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  24.61 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  24.02 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  25.99 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  27.71 
 
 
423 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.91 
 
 
448 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  26.41 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  25.07 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  31.79 
 
 
411 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 
434 aa  63.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.72 
 
 
440 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.72 
 
 
440 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  30.25 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.85 
 
 
428 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  27.18 
 
 
423 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 
443 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  27.89 
 
 
384 aa  60.1  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
402 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25.12 
 
 
430 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  23.44 
 
 
439 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  26.46 
 
 
439 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  25 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  37.61 
 
 
432 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
432 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  24.16 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  25.19 
 
 
440 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  25.14 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
403 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 
386 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  24.85 
 
 
417 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  25 
 
 
434 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  26.24 
 
 
435 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1199  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.73 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  25.1 
 
 
403 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  24.2 
 
 
398 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  24.2 
 
 
398 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  24.2 
 
 
398 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  25.25 
 
 
434 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  24.91 
 
 
431 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  24.21 
 
 
428 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.29 
 
 
432 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  24.21 
 
 
445 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  24.21 
 
 
445 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 
219 aa  56.6  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  23.33 
 
 
446 aa  56.2  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  25.66 
 
 
430 aa  56.2  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  25.63 
 
 
474 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  23.33 
 
 
446 aa  56.2  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  22.78 
 
 
434 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3315  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.14 
 
 
387 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3172  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.73 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  25.66 
 
 
430 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3235  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  24.41 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  33.15 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  25.14 
 
 
474 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
440 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  22.13 
 
 
445 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  22.13 
 
 
445 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  30.26 
 
 
441 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  28.31 
 
 
415 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  28.93 
 
 
481 aa  55.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  25.14 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  29.07 
 
 
453 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  23.83 
 
 
439 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  25.14 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.86 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  21.96 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  23.49 
 
 
430 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  25.14 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  24.54 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2289  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
483 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1082  major facilitator transporter  26.29 
 
 
392 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499902  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  25.14 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>