More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3044 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3044  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
432 aa  880    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0803545 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2681  aspartyl-tRNA synthetase  81.34 
 
 
434 aa  729    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2727  aspartyl-tRNA synthetase  85.25 
 
 
434 aa  752    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1072  aspartyl-tRNA synthetase  84.79 
 
 
434 aa  738    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0623  aspartyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 
434 aa  487  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0512708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3173  aspartyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 
444 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.000147648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0276  aspartyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
424 aa  483  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.825519  normal  0.0515274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0772  aspartyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
443 aa  472  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2446  aspartyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0039  aspartyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 
429 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.227314  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0105  aspartyl-tRNA synthetase  53 
 
 
430 aa  462  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2151  aspartyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 
429 aa  464  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0028  aspartyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
438 aa  436  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0926  aspartyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
438 aa  435  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1053  aspartyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
438 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1792  aspartyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
438 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0864  aspartyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
438 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321386  hitchhiker  0.00505201 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0465  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0205  aspartyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
429 aa  352  8.999999999999999e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.398842  normal  0.035256 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1066  aspartyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
428 aa  342  8e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0679  aspartyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
429 aa  335  7e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.536665  normal  0.389119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2119  aspartyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
428 aa  334  2e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2350  aspartyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
428 aa  333  5e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.139138 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0746  aspartyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
430 aa  330  3e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.24363 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1151  aspartyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
429 aa  328  8e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1657  aspartyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
434 aa  327  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.851276  normal  0.322475 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1987  aspartyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
429 aa  325  9e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2031  aspartyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
432 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000122417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2186  aspartyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
432 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1999  aspartyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
432 aa  316  6e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000061616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2205  aspartyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
432 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000134877 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1981  aspartyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0153601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0871  aspartyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
436 aa  311  1e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0914836 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3128  aspartyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
432 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000139921  normal  0.0236785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2191  aspartyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
432 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2327  aspartyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
432 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000033023  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0796  aspartyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
439 aa  297  3e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.740603  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1884  aspartyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
423 aa  296  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455138  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0770  aspartyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 
429 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0321023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2021  aspartyl-tRNA synthetase  40 
 
 
432 aa  292  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00586972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0628  aspartyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
421 aa  291  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2287  aspartyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
423 aa  282  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0265879  hitchhiker  0.000764626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1527  aspartyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
433 aa  276  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133042 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0636  aspartyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
445 aa  269  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1139  tRNA synthetase class II (D K and N)  36.18 
 
 
441 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.221596  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2124  aspartyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
436 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00223475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1870  Aspartate--tRNA ligase  38.11 
 
 
428 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4171  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.47 
 
 
437 aa  249  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1542  asparaginyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
430 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1513  asparaginyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
430 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0809423  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1024  asparaginyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5912  tRNA synthetase class II (D K and N)  37.1 
 
 
430 aa  242  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.339268 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88658  predicted protein  36.08 
 
 
491 aa  242  9e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1342  asparaginyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
431 aa  241  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.658334  normal  0.0839865 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2111  asparaginyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 
430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1189  aspartyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
424 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.384955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0508  asparaginyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 
431 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1752  asparaginyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
431 aa  238  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.271422  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0375  asparaginyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0470506 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77216  aspartyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
573 aa  235  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0799  asparaginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
431 aa  233  5e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0829958  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1885  asparaginyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 
432 aa  233  6e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00255818  normal  0.527696 
 
 
-
 
NC_006686  CND06300  aspartate-tRNA ligase, putative  33.91 
 
 
567 aa  231  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.051221  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00400  aspartate--tRNA ligase, putative  33.71 
 
 
884 aa  231  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04550  aspartyl-tRNA synthetase Dps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02590)  35.06 
 
 
555 aa  231  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0366601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4889  Aspartate--tRNA ligase  36.09 
 
 
447 aa  230  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1133  asparaginyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
431 aa  227  3e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.563116 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1097  asparaginyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 
434 aa  227  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0527  asparaginyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
431 aa  224  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0846  asparaginyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 
430 aa  224  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4597  asparaginyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 
442 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1381  asparaginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0878825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1281  asparaginyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 
429 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
431 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0099  asparaginyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
461 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0848  asparaginyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
430 aa  219  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3597  asparaginyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1136  asparaginyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
449 aa  216  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.197161  hitchhiker  0.00686956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
440 aa  216  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.214123  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_42051  predicted protein  33.97 
 
 
579 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2042  asparaginyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109119  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07479  cytoplasmic asparaginyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05650)  33.1 
 
 
574 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357268  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1886  asparaginyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291835  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 
463 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0931  asparaginyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
433 aa  212  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2127  asparaginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
441 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.619552  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33068  Asparaginyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Asparagine--tRNA ligase) (AsnRS)  32.49 
 
 
553 aa  212  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3378  asparaginyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
461 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2020  asparaginyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
447 aa  210  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.441721  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0864  asparaginyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 
448 aa  208  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.756998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0882  asparaginyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 
461 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00314  aspartatyl tRNA synthetase, hypothetical protein (Eurofung)  37.5 
 
 
956 aa  206  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0526  asparaginyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
448 aa  206  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2728  asparaginyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 
434 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2087  asparaginyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 
471 aa  206  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1193  asparaginyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 
432 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
462 aa  205  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2912  asparaginyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 
434 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3630  asparaginyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 
463 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.256869 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2820  asparaginyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 
434 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>