174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1734 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  100 
 
 
192 aa  380  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  72.92 
 
 
192 aa  261  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  63.02 
 
 
192 aa  241  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  64.48 
 
 
191 aa  231  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  64.48 
 
 
191 aa  231  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  50.26 
 
 
203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  47.62 
 
 
204 aa  168  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  47.98 
 
 
175 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  51.43 
 
 
172 aa  155  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  49.04 
 
 
179 aa  152  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  39.88 
 
 
189 aa  148  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  44.32 
 
 
180 aa  141  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  39.88 
 
 
182 aa  140  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  41.95 
 
 
180 aa  136  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  41.52 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  43.18 
 
 
176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  42.77 
 
 
177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  39.77 
 
 
178 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  39.66 
 
 
187 aa  129  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  42.95 
 
 
178 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  41.67 
 
 
178 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  41.94 
 
 
181 aa  122  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  41.67 
 
 
178 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  41.94 
 
 
174 aa  119  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  40.8 
 
 
178 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  40.38 
 
 
184 aa  115  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  39.1 
 
 
184 aa  111  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  37.18 
 
 
184 aa  100  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  37.74 
 
 
184 aa  100  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  30.85 
 
 
251 aa  84.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  34.66 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  36.42 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  33.99 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  35.06 
 
 
327 aa  82  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  29.28 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  27.84 
 
 
529 aa  59.3  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  31.76 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  31.07 
 
 
227 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  30.61 
 
 
220 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.37 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2381  cytidylate kinase-like  25.95 
 
 
242 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_002620  TC0737  cytidylate kinase  50 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  28.78 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  29.73 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  29.09 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  25 
 
 
232 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  29.12 
 
 
275 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  51.28 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  26.47 
 
 
226 aa  48.9  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  25 
 
 
233 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  46.15 
 
 
240 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  27.59 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  25.51 
 
 
275 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  48.94 
 
 
237 aa  48.1  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  26 
 
 
227 aa  48.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  58.33 
 
 
181 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  58.33 
 
 
181 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  58.33 
 
 
181 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0760  cytidylate kinase  27.85 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  40.68 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  53.85 
 
 
811 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  55.26 
 
 
224 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0349  cytidylate kinase  25.17 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.229636  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0587  hypothetical protein  31.86 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618354  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  43.59 
 
 
233 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  43.59 
 
 
233 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  47.92 
 
 
243 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  26.71 
 
 
221 aa  45.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  54.05 
 
 
181 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  28.06 
 
 
212 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  27.64 
 
 
233 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  29.17 
 
 
208 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  38.81 
 
 
181 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  46.94 
 
 
237 aa  45.1  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  41.27 
 
 
221 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  60 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  46.81 
 
 
218 aa  44.7  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0128  cytidylate kinase  25.49 
 
 
221 aa  45.1  0.0007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  50 
 
 
674 aa  44.7  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  48.72 
 
 
238 aa  44.7  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  47.5 
 
 
212 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0909  cytidylate kinase  44 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  47.22 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0403  cytidylate kinase  29.49 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0508  cytidylate kinase  27.33 
 
 
221 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  22.83 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  25 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  46.15 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  35 
 
 
228 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  55.56 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  55.88 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  50 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  48.57 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  37.31 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  50 
 
 
226 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  43.59 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  50 
 
 
230 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  37.31 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  48.65 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  52.63 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>