More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0398 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
311 aa  627  1e-179  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 
314 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
320 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.75 
 
 
285 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
316 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
291 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
322 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
317 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
276 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
302 aa  89.4  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.81 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 
303 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.57 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.87 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  30.56 
 
 
241 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.87 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.526116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  25.22 
 
 
351 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.53 
 
 
376 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1368  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.16 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.33 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
352 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
245 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 
250 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.49 
 
 
297 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
292 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
295 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
296 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
296 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
296 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.19 
 
 
193 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
324 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  23.4 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.88 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  26.79 
 
 
333 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 
324 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  27.54 
 
 
316 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1504  NAD dependent protein  25.5 
 
 
328 aa  59.7  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.76 
 
 
296 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  28.12 
 
 
300 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
330 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.87 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.53 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 
366 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.1 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  23.62 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  24.72 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3156  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.45 
 
 
361 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0412358  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1836  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311828  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
286 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.78 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  33.61 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4109  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.27 
 
 
371 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4340  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.27 
 
 
371 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123025 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4185  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.27 
 
 
371 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0437586  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1716  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.26 
 
 
373 aa  57  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 
292 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>