More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0273 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
121 aa  243  4.9999999999999997e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  51.64 
 
 
124 aa  124  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  52.48 
 
 
122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  52.48 
 
 
122 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0843  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 
127 aa  96.7  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2044  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 
357 aa  87.8  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  35.4 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  36.75 
 
 
121 aa  77  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  34.95 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  38.61 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  38.61 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  38.61 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  38.61 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  38.61 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  33.04 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  38.61 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
115 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  38.61 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  38.61 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  32.67 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  33.68 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  39.39 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  34.74 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6398  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  33.96 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6631  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.932723  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  42.53 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6229  HxlR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25386  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  42.05 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  33.68 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  33.01 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  37.93 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  34.86 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
127 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  43.68 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  38.46 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  38.46 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  37.5 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  38.46 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  33.68 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  35.19 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0952  transcriptional regulator  34.83 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000720896  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  35.19 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  40.4 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  36.26 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  35.35 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  38.46 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  31.37 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  34.04 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  31.37 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  31.37 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  38.82 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  40 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  40 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>