54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2030 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  100 
 
 
355 aa  713    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  70.99 
 
 
356 aa  501  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  70.42 
 
 
355 aa  491  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  69.01 
 
 
355 aa  488  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  68.45 
 
 
355 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  40.22 
 
 
347 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  40.56 
 
 
350 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  40.34 
 
 
351 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  34.9 
 
 
348 aa  228  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  32.36 
 
 
348 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  31.79 
 
 
348 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  32.07 
 
 
348 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  32.27 
 
 
348 aa  216  7e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  34.93 
 
 
341 aa  209  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  33.91 
 
 
342 aa  206  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  34.87 
 
 
341 aa  205  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  33.24 
 
 
340 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  33.81 
 
 
341 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  34.38 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  30.68 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  29.58 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  27.87 
 
 
413 aa  133  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  31.34 
 
 
341 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  28.42 
 
 
403 aa  122  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  26.72 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  23.63 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  25.54 
 
 
395 aa  105  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  27.09 
 
 
333 aa  93.6  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  26.93 
 
 
337 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  25.07 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  25.64 
 
 
332 aa  85.9  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  23.92 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  27.64 
 
 
410 aa  60.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  25.51 
 
 
417 aa  56.6  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  25.76 
 
 
426 aa  56.6  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  22.37 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  25.38 
 
 
419 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  28.11 
 
 
406 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  26.37 
 
 
357 aa  51.2  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  24.51 
 
 
419 aa  49.7  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  26.49 
 
 
358 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  24.49 
 
 
417 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  26.15 
 
 
416 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  26.87 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  24.39 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  25.38 
 
 
419 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  25.63 
 
 
419 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  26.63 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  25.1 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  28.43 
 
 
417 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  28.5 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  24.88 
 
 
415 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  26.74 
 
 
423 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  25.13 
 
 
419 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>