228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1829 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  100 
 
 
338 aa  659    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  71.22 
 
 
328 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  73.37 
 
 
330 aa  429  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  69.94 
 
 
327 aa  422  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  70.33 
 
 
328 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  38.94 
 
 
321 aa  169  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  37.7 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  39.16 
 
 
301 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  36.47 
 
 
322 aa  149  7e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  35.61 
 
 
290 aa  149  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  34.23 
 
 
289 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  36.04 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  34.51 
 
 
289 aa  133  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  30.82 
 
 
313 aa  126  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  31.12 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  34.23 
 
 
289 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  31.07 
 
 
316 aa  113  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  35.64 
 
 
315 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  31.63 
 
 
313 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  34.11 
 
 
310 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  30.27 
 
 
317 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  27.04 
 
 
432 aa  103  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  28.23 
 
 
314 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  28.91 
 
 
317 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  28.38 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  31.86 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  29.55 
 
 
361 aa  98.6  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  37.58 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  30.7 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  33.44 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  29.35 
 
 
735 aa  96.7  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  28.57 
 
 
319 aa  94  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  33.73 
 
 
359 aa  90.1  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  27.3 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  29.61 
 
 
490 aa  90.1  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  32.68 
 
 
316 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  30.56 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  32.02 
 
 
356 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  29.84 
 
 
310 aa  87  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  26.62 
 
 
313 aa  86.7  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  26.62 
 
 
313 aa  86.7  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  30.45 
 
 
900 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  31.17 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  30.9 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  29.65 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  25.43 
 
 
387 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  28.25 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  24.53 
 
 
395 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  26.15 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  27.95 
 
 
369 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  28.14 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  25.14 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  28.1 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  27.9 
 
 
391 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  28.1 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  28.7 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  27.02 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  26.21 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  28.7 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  28.53 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  27.25 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  29.67 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  32.09 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0465  GHMP kinase  24.65 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0240407  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  26.91 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  27.6 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  28.11 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  26.61 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  26.71 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  25 
 
 
393 aa  67  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  23.98 
 
 
384 aa  67  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  25.48 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  29.39 
 
 
391 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  25.23 
 
 
386 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  25.37 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  25.37 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  25.37 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  25.37 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  25.37 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  25 
 
 
388 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  25.37 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  28.57 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  23.68 
 
 
399 aa  63.5  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  31.8 
 
 
347 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  25.22 
 
 
386 aa  63.9  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  28.02 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  23.72 
 
 
387 aa  63.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  30.38 
 
 
314 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  25.07 
 
 
386 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  26.09 
 
 
388 aa  62.8  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  27.16 
 
 
383 aa  62.8  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  29.04 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  25.22 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  25.07 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  25.53 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  25.07 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  25.41 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  25.81 
 
 
389 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  26.8 
 
 
286 aa  62  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  31.72 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>