132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1164 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1164  formate dehydrogenase gamma subunit  100 
 
 		 261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0635  formate dehydrogenase gamma subunit  51.85 
 
 		 242 aa  258  6e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11337 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2336  formate dehydrogenase gamma subunit  34.43 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.723504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0680  formate dehydrogenase gamma subunit  31.2 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0506  formate dehydrogenase, gamma subunit  25 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.579311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.2 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5489  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.51 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4059  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.7 
 
 		 408 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2451  formate dehydrogenase gamma subunit  28.95 
 
 		 339 aa  58.9  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779662  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3258  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.23 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.263075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3263  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.87 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.69 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3725  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.79 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.455366 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2812  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.69 
 
 		 490 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0837  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.11 
 
 		 390 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1173  formate dehydrogenase gamma subunit  28.33 
 
 		 388 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601281  normal  0.202143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4138  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.01 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4108  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.01 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0231  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.01 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4226  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.01 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4520  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.05 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0452  formate dehydrogenase gamma subunit  30.25 
 
 		 226 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1573  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.38 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02280  formate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  23.53 
 
 		 350 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3327  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.07 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.582941 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1927  formate dehydrogenase, putative  23.14 
 
 		 220 aa  52  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.58806  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0403  formate dehydrogenase gamma subunit  25.18 
 
 		 404 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0151738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3372  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.67 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2640  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.38 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.174669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3252  formate dehydrogenase gamma subunit  31.43 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3722  formate dehydrogenase gamma subunit  25.97 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.973901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3793  formate dehydrogenase gamma subunit  25.97 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3379  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.48 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.765789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0709  formate dehydrogenase gamma subunit  31.43 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3918  formate dehydrogenase gamma subunit  25.97 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0546  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.29 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3881  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.48 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208966  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3922  formate dehydrogenase, putative  31.43 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5280  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.08 
 
 		 339 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4511  formate dehydrogenase, C subunit, putative  25.51 
 
 		 342 aa  49.7  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1289  formate dehydrogenase gamma subunit  27.31 
 
 		 370 aa  49.7  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2700  formate dehydrogenase gamma subunit  23.53 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604172  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0335  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.46 
 
 		 342 aa  49.3  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3488  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.45 
 
 		 208 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4595  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.48 
 
 		 208 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.473714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1823  formate dehydrogenase gamma subunit  22.34 
 
 		 219 aa  48.9  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.95 
 
 		 696 aa  48.9  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1745  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.41 
 
 		 218 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.504585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0061  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.33 
 
 		 335 aa  48.9  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1597  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.41 
 
 		 218 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003492  formate dehydrogenase -O gamma subunit  23.31 
 
 		 350 aa  48.9  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1684  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.41 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2631  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.07 
 
 		 491 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0870  formate dehydrogenase gamma subunit  25.99 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1775  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.41 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2425  formate dehydrogenase gamma subunit  27.23 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2827  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.81 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.501112  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1694  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.03 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1682  formate dehydrogenase-N subunit gamma  21.99 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4811  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.18 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3542  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.57 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0474806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2098  formate dehydrogenase gamma subunit  25.91 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.976655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3662  formate dehydrogenase gamma subunit  24.55 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3726  formate dehydrogenase gamma subunit  24 
 
 		 327 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3922  formate dehydrogenase gamma subunit  24 
 
 		 327 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3461  formate dehydrogenase gamma subunit  25 
 
 		 401 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.293351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  19.61 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0709  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.73 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2551  formate dehydrogenase gamma subunit  25.61 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233004  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3797  formate dehydrogenase gamma subunit  24 
 
 		 327 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2788  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.33 
 
 		 401 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0675337  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1118  formate dehydrogenase, cytochrome B556 subunit  24.07 
 
 		 357 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6558  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.61 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892588  hitchhiker  0.000719745 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1455  putative formate dehydrogenase  22.65 
 
 		 339 aa  46.2  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1208  formate dehydrogenase, gamma subunit, putative  25.52 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7398  formate dehydrogenase gamma subunit  28.45 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3607  formate dehydrogenase, C subunit, putative  28.45 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.394168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0283  formate dehydrogenase gamma subunit  24.55 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1681  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.57 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0728  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.57 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2394  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.57 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0099056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2257  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.57 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0685  formate dehydrogenase gamma subunit  22.55 
 
 		 398 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3089  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.08 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971342  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2370  hypothetical protein  27.88 
 
 		 384 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4380  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.45 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3986  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.45 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0660  formate dehydrogenase, gamma subunit  21.97 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0549126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0440  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.04 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0107  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.77 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4807  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.09 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1333  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.08 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2758  formate dehydrogenase subunit gamma  25.45 
 
 		 397 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0059  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.36 
 
 		 338 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1483  formate dehydrogenase, cytochrome B subunit  23.81 
 
 		 317 aa  43.5  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1901  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.11 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0573  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.11 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0102  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.36 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0106  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.36 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4135  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.36 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>