155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4315 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  100 
 
 
313 aa  620  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  50.65 
 
 
314 aa  276  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  49.35 
 
 
314 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  48.7 
 
 
316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  36.48 
 
 
286 aa  159  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  36.45 
 
 
322 aa  155  9e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  31.92 
 
 
310 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  34.65 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  33.44 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  29.7 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  36.42 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  31.77 
 
 
303 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  30.24 
 
 
322 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  31.21 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  31.21 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  32 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  32.47 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  30.5 
 
 
316 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  30.13 
 
 
290 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  26.52 
 
 
276 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  29.05 
 
 
301 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  27.3 
 
 
313 aa  103  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  31.63 
 
 
338 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  31.13 
 
 
306 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  32.99 
 
 
328 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  34 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  32.2 
 
 
356 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  29.27 
 
 
349 aa  95.9  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  30.3 
 
 
289 aa  92  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  29.91 
 
 
400 aa  88.6  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  33.12 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  24.78 
 
 
432 aa  87.4  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  28.83 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  30.53 
 
 
347 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  26.72 
 
 
900 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  30.46 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  29.77 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  29.01 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  24.38 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  30.03 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  27.85 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  26.63 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  24.85 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  25.63 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  27.3 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  25.55 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  26.52 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  28.21 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  26.69 
 
 
735 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  27.67 
 
 
385 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  27.65 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  22.37 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  23.89 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  28.23 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  28.1 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  23.27 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  23.73 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  27.9 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  23.32 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  27.99 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  28.88 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4183  GHMP kinase  23.81 
 
 
347 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127496  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  27.24 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  27.24 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  30.09 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  27.48 
 
 
394 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  24.68 
 
 
349 aa  63.5  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  28.9 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  25.54 
 
 
400 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  26.64 
 
 
361 aa  62  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  25.3 
 
 
403 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  23.4 
 
 
355 aa  59.3  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  27.12 
 
 
490 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  39.76 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  22.47 
 
 
404 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  27.65 
 
 
395 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  28.16 
 
 
348 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  25.88 
 
 
399 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  26.29 
 
 
351 aa  56.6  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  25.79 
 
 
391 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  23.83 
 
 
295 aa  55.8  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  22.87 
 
 
380 aa  55.8  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  23.53 
 
 
405 aa  55.8  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  40.24 
 
 
407 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  25.3 
 
 
356 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  27.81 
 
 
391 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  24.9 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  24.86 
 
 
372 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44406  predicted protein  26.5 
 
 
1782 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0950443  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  23.91 
 
 
393 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  39.51 
 
 
390 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  23.46 
 
 
392 aa  53.5  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  27.38 
 
 
370 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  25.44 
 
 
383 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  25.54 
 
 
369 aa  52.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  22.7 
 
 
387 aa  52.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  23.19 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  46.03 
 
 
394 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  24.34 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82625  galactokinase  34.33 
 
 
518 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.560809  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>