More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2644 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
362 aa  748    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.24 
 
 
405 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  38.39 
 
 
415 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  32.91 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  38.53 
 
 
418 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  38.53 
 
 
418 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  36.04 
 
 
434 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  35.29 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  34.6 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  38.57 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  34.91 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.49 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  39.77 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  35.68 
 
 
368 aa  126  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  37.23 
 
 
446 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  32.47 
 
 
361 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.12 
 
 
405 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  34.26 
 
 
443 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  38.6 
 
 
328 aa  123  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  37.5 
 
 
406 aa  122  7e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  34.47 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.96 
 
 
431 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  33.18 
 
 
423 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  37.43 
 
 
335 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  31.91 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.8 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  33.18 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  32.54 
 
 
374 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  37.84 
 
 
319 aa  116  7.999999999999999e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  34.3 
 
 
334 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  32.59 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  32.42 
 
 
431 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  33.85 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  31.46 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  36 
 
 
460 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  36 
 
 
460 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.57 
 
 
387 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  37.91 
 
 
320 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  30.64 
 
 
465 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  32.98 
 
 
386 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  30.85 
 
 
348 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  34.53 
 
 
409 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  34.78 
 
 
379 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  35.86 
 
 
385 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  31.73 
 
 
342 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  35.93 
 
 
437 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  29.91 
 
 
375 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  32.62 
 
 
313 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  31.02 
 
 
371 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 
468 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  31.82 
 
 
390 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  32.79 
 
 
416 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  33.72 
 
 
329 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  31.56 
 
 
402 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  31.03 
 
 
361 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  33.16 
 
 
336 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  29.95 
 
 
438 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  34.41 
 
 
305 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  29.18 
 
 
698 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  29.21 
 
 
489 aa  100  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  34.3 
 
 
438 aa  99.8  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  28.76 
 
 
686 aa  99.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  34.1 
 
 
318 aa  99.4  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.73 
 
 
451 aa  99  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  34.08 
 
 
324 aa  99  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 
398 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  30.53 
 
 
283 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  32.55 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.96 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  30.88 
 
 
488 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  35.93 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  31.64 
 
 
632 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 
373 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  31.91 
 
 
350 aa  96.7  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 
395 aa  96.7  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  32.58 
 
 
456 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.37 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.7 
 
 
415 aa  96.3  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  33.7 
 
 
320 aa  95.9  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  32.58 
 
 
456 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  29.18 
 
 
689 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  34.88 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  34.1 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  33.14 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  34.39 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  33 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.05 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  34.39 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 
462 aa  94.4  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.7 
 
 
395 aa  94  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  32.54 
 
 
413 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  32.37 
 
 
406 aa  94  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  32.56 
 
 
350 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  32.16 
 
 
727 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  32.6 
 
 
364 aa  93.2  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
370 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  31.11 
 
 
349 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1749  DNA-cytosine methyltransferase  35.79 
 
 
350 aa  92.8  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000535565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  33.52 
 
 
350 aa  92.8  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>