289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1749 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1749  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
350 aa  723    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000535565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  75.14 
 
 
350 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  71.71 
 
 
350 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  65.24 
 
 
370 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  60.17 
 
 
371 aa  408  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  41.44 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  43.73 
 
 
379 aa  202  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  37.02 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  32.41 
 
 
313 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  33.54 
 
 
334 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  32.15 
 
 
310 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.38 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.83 
 
 
313 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  32.42 
 
 
308 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  29.5 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  33.62 
 
 
423 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  30.88 
 
 
368 aa  137  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  31.09 
 
 
319 aa  124  3e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  31.9 
 
 
328 aa  122  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  29.12 
 
 
438 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
350 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.17 
 
 
357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.49 
 
 
335 aa  116  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  27.34 
 
 
489 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  29.13 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  27.89 
 
 
402 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.79 
 
 
362 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  29.19 
 
 
335 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  29.38 
 
 
362 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  28.92 
 
 
329 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  26.95 
 
 
395 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.92 
 
 
362 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  27.61 
 
 
329 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.57 
 
 
405 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  33.87 
 
 
406 aa  103  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
338 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  32.61 
 
 
400 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  28.96 
 
 
324 aa  102  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  26.44 
 
 
416 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.53 
 
 
328 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  25.86 
 
 
373 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  30.03 
 
 
465 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
454 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  29.38 
 
 
632 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 
318 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 
395 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  28.66 
 
 
414 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
398 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  25.33 
 
 
409 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  27.71 
 
 
320 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  27.49 
 
 
615 aa  97.1  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.18 
 
 
348 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  27.89 
 
 
336 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  26.78 
 
 
361 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  31.03 
 
 
320 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.09 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  27.22 
 
 
327 aa  94  3e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  26.38 
 
 
727 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  26.02 
 
 
424 aa  92.8  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  25.68 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  25.44 
 
 
689 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 
468 aa  90.9  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  31.12 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  27.05 
 
 
375 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  24.73 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  26.09 
 
 
331 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.11 
 
 
359 aa  89.7  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  24.59 
 
 
390 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  23.32 
 
 
468 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  25.97 
 
 
657 aa  89  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  25.8 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.05 
 
 
387 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  25.46 
 
 
698 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.32 
 
 
305 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  25.98 
 
 
686 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  25.93 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  25.86 
 
 
420 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 
406 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 
319 aa  87  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  25.79 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.95 
 
 
431 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 
412 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  31.95 
 
 
483 aa  86.3  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 
671 aa  86.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 
355 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  25.93 
 
 
662 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.08 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 
657 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  25.71 
 
 
474 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  27.95 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25.8 
 
 
325 aa  84  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>