More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2148 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2148  response regulator receiver protein  100 
 
 
141 aa  288  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1271  response regulator receiver protein  63.91 
 
 
138 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0205  response regulator receiver protein  45.38 
 
 
136 aa  130  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.879703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2144  response regulator receiver protein  47.73 
 
 
148 aa  120  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1609  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1710  response regulator receiver protein  42.03 
 
 
155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.198048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4403  response regulator receiver protein  40.77 
 
 
138 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1833  response regulator receiver protein  31.39 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
391 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
702 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3148  response regulator receiver protein  32.58 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
1159 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
657 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 
702 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  34.55 
 
 
702 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
391 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  29.77 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  37.72 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  31.75 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0988  response regulator receiver  33.61 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.634077  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
397 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  29.84 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  31.5 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1546  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.15 
 
 
368 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1575  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
577 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.420465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.55 
 
 
1218 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3353  response regulator receiver protein  31.2 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152835  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
1177 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  28.45 
 
 
1137 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 
364 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  31.71 
 
 
1206 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  26.92 
 
 
1871 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 
1137 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  28.23 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 
623 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2207  response regulator receiver protein  31.48 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  26.32 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  33.06 
 
 
772 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3819  response regulator receiver protein  32.67 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.752966  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  37.61 
 
 
786 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  36.7 
 
 
779 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1284 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  31.91 
 
 
958 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  25.62 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  34.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 
1954 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  27.01 
 
 
155 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 
1194 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 
1588 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
944 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.84 
 
 
1380 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
1189 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  29.66 
 
 
1158 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 
1159 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  31.86 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 
1168 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 
1195 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2021  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
1082 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.04 
 
 
404 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2077  sensor histidine kinase/response regulator  34.45 
 
 
1082 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.981024  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2224  putative two-component regulatory system, sensor kinase protein  34.45 
 
 
1082 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  34.55 
 
 
685 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4464  response regulator receiver domain-containing protein  28.7 
 
 
250 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2355  response regulator receiver protein  29.13 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  27.87 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1691 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1030  response regulator receiver protein  36.62 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
1310 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  27.91 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  30.16 
 
 
1392 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.06 
 
 
935 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1468 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  28.24 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
1356 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  32.2 
 
 
785 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  32.2 
 
 
785 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2316  sensor histidine kinase/response regulator  30.89 
 
 
477 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  24.59 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  27.91 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  25 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  28.23 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.2 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 
1352 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  28 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  29.37 
 
 
122 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  28 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  32.48 
 
 
785 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0504  response regulator receiver protein  28 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0548558  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2407  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
577 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45485  ethylene receptor 1  29.23 
 
 
833 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.454805  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  33.61 
 
 
693 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.81 
 
 
1143 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  27.91 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3985  signal transduction histidine protein kinase  34.75 
 
 
1156 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0386149 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  37.5 
 
 
222 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  37.5 
 
 
222 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2758  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
857 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1070  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
575 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.677044  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 
944 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>